M6A 编辑
N-甲基腺苷是真核生物细胞MRNA中最常见的修饰,也见于TRNA核糖体RNASnRNALncRNA等其他种RNA,细胞RNA中约有0.1%至0.4%的腺苷位点具有此修饰。m6A最早在1970年代即被发现,但未知其功能,近年随着其修饰酶、去修饰酶和识别蛋白的发现,其修饰机制与功能逐渐明朗。m6A是由一甲基转移酶复合体修饰,复合体包括METTL3、METTL14、WTAP、RBM15、KIAA1429与METTL5等,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到RNA的腺苷上;FTO基因蛋白与ALKBH5则为m6A去甲基酶,可移除RNA上m6A的甲基;具YTH结构域的蛋白、IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、FMR1和RBMX等蛋白可与mRNA上的m6A结合,为其识别蛋白,因蛋白种类和RNA序列而异可促进或抑制其转译、降解、RNA剪接等。研究m6A转录组的技术包括m6A测序、mRNA甲基化测序、m6A-CLIP与SCARLET等。有数种癌症与m6A修饰的异常有关。除真核生物外,许多RNA病毒也具有m6A修饰,可能与其感染、复制有关。
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强化子RNA是真核生物基因组中强化子序列转录产生的非编码RNA,长50核碱基至4000nt之间,此类RNA于2010年由RNA测序与ChIP-seq等大规模测序技术测得。强化子为基因组中与RNA聚合酶Ⅱ、中介体和转录因子结合以启动基因转录的重要序列,其转录生成的强化子RNA大多留在细胞核中,此类RNA大多不稳定,易被细胞核中的外切体降解,但可能可调控其他基因的转录。并非所有强化子皆可转录,有研究显示仅有少数强化子可转录产生出eRNA,可能为较为活跃的强化子。有些强化子RNA具复杂的次级结构,并带有M6A等碱基修饰。
强化子RNA是真核生物基因组中强化子序列转录产生的非编码RNA,长50核碱基至4000nt之间,此类RNA于2010年由RNA测序与ChIP-seq等大规模测序技术测得。强化子为基因组中与RNA聚合酶Ⅱ、中介体和转录因子结合以启动基因转录的重要序列,其转录生成的强化子RNA大多留在细胞核中,此类RNA大多不稳定,易被细胞核中的外切体降解,但可能可调控其他基因的转录。并非所有强化子皆可转录,有研究显示仅有少数强化子可转录产生出eRNA,可能为较为活跃的强化子。有些强化子RNA具复杂的次级结构,并带有M6A等碱基修饰。