N6-甲基腺苷 编辑
N-甲基腺苷是真核生物细胞MRNA中最常见的修饰,也见于TRNA核糖体RNASnRNALncRNA等其他种RNA,细胞RNA中约有0.1%至0.4%的腺苷位点具有此修饰。m6A最早在1970年代即被发现,但未知其功能,近年随着其修饰酶、去修饰酶和识别蛋白的发现,其修饰机制与功能逐渐明朗。m6A是由一甲基转移酶复合体修饰,复合体包括METTL3、METTL14、WTAP、RBM15、KIAA1429与METTL5等,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到RNA的腺苷上;FTO基因蛋白与ALKBH5则为m6A去甲基酶,可移除RNA上m6A的甲基;具YTH结构域的蛋白、IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、FMR1和RBMX等蛋白可与mRNA上的m6A结合,为其识别蛋白,因蛋白种类和RNA序列而异可促进或抑制其转译、降解、RNA剪接等。研究m6A转录组的技术包括m6A测序、mRNA甲基化测序、m6A-CLIP与SCARLET等。有数种癌症与m6A修饰的异常有关。除真核生物外,许多RNA病毒也具有m6A修饰,可能与其感染、复制有关。
1
相关
YTHDF2是一个位于人类第1号染色体上的基因,编码一种属于YTH蛋白质超家族下的蛋白YTHDF1。YTHDF1基因编码的YTHDF1蛋白能够识别并结合N6-甲基腺苷转录后修饰的MRNA,并增加与之结合的mRNA易位效率。YTHDF2蛋白除含有YTH结构域外,还含有一个可能与信号转导相关的高脯氨酸区。
METTL3全称为甲基转移酶样蛋白3,又称N6-腺苷甲基转移酶复合体催化亚基,在人类基因组中由14号染色体上的METTL3基因编码。此蛋白为N6-腺苷甲基转移酶复合体中具甲基转移酶活性的组成蛋白,由580个氨基酸组成,大小为70kDa,包含一锌指结构域与一甲基转移酶结构域,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到MRNA中的腺苷上,将其甲基化成N6-甲基腺苷。METTL3与另一蛋白METTL14共同组成N6-腺苷甲基转移酶复合体的核心,但METTL14在此复合体中仅有与RNA结合和稳定结构的功能,无催化甲基化的功能。METTL3的基因表现异常与多种癌症有关,许多案例中METTL3为致癌基因,在许多癌症中表现量增加。
YTHDF3是一个位于人类第8号染色体上的基因,编码蛋白YTHDF3蛋白。YTHDF3基因与YTHDF1属同源,编码的YTHDF3蛋白功能可能是识别并结合N6-甲基腺苷转录后修饰的MRNA,并增加与之结合的mRNA易位效率。
YTHDF1是一个位于人类第20号染色体上的基因,编码蛋白YTHDF1蛋白。YTHDF1基因编码的YTHDF1蛋白能够识别并结合N6-甲基腺苷转录后修饰的MRNA,并增加与之结合的mRNA易位效率。
FTO基因全称脂肪和肥胖相关基因,在人类基因组中位于16号染色体,此基因编码的FTO蛋白属AlkB家族,为α-酮戊二酸依赖性羟化酶。此基因可能与肥胖症有关。2011年何川实验室发现FTO蛋白可将MRNA上的N6-甲基腺苷去甲基化成腺苷,为第一个被发现的mRNA去甲基酶。