SnRNA 编辑
小核RNA,是含有100到300碱基RNA
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N-甲基腺苷是真核生物细胞MRNA中最常见的修饰,也见于TRNA、核糖体RNA、SnRNA和LncRNA等其他种RNA,细胞RNA中约有0.1%至0.4%的腺苷位点具有此修饰。m6A最早在1970年代即被发现,但未知其功能,近年随着其修饰酶、去修饰酶和识别蛋白的发现,其修饰机制与功能逐渐明朗。m6A是由一甲基转移酶复合体修饰,复合体包括METTL3、METTL14、WTAP、RBM15、KIAA1429与METTL5等,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到RNA的腺苷上;FTO基因蛋白与ALKBH5则为m6A去甲基酶,可移除RNA上m6A的甲基;具YTH结构域的蛋白、IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、FMR1和RBMX等蛋白可与mRNA上的m6A结合,为其识别蛋白,因蛋白种类和RNA序列而异可促进或抑制其转译、降解、RNA剪接等。研究m6A转录组的技术包括m6A测序、mRNA甲基化测序、m6A-CLIP与SCARLET等。有数种癌症与m6A修饰的异常有关。除真核生物外,许多RNA病毒也具有m6A修饰,可能与其感染、复制有关。
N-甲基腺苷是真核生物细胞MRNA中最常见的修饰,也见于TRNA、核糖体RNA、SnRNA和LncRNA等其他种RNA,细胞RNA中约有0.1%至0.4%的腺苷位点具有此修饰。m6A最早在1970年代即被发现,但未知其功能,近年随着其修饰酶、去修饰酶和识别蛋白的发现,其修饰机制与功能逐渐明朗。m6A是由一甲基转移酶复合体修饰,复合体包括METTL3、METTL14、WTAP、RBM15、KIAA1429与METTL5等,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到RNA的腺苷上;FTO基因蛋白与ALKBH5则为m6A去甲基酶,可移除RNA上m6A的甲基;具YTH结构域的蛋白、IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、FMR1和RBMX等蛋白可与mRNA上的m6A结合,为其识别蛋白,因蛋白种类和RNA序列而异可促进或抑制其转译、降解、RNA剪接等。研究m6A转录组的技术包括m6A测序、mRNA甲基化测序、m6A-CLIP与SCARLET等。有数种癌症与m6A修饰的异常有关。除真核生物外,许多RNA病毒也具有m6A修饰,可能与其感染、复制有关。
卡哈尔体,是存在于细胞核里的细胞器。卡哈尔体是相当具保留性的核细胞器。到目前为止,在脊椎动物、果蝇、酵母菌,以及植物中均发现存在卡哈尔体。尽管卡哈尔体被发现已经100多年,卡哈尔体的确切功能还不是很明朗。初步证据显卡哈尔体可能与参与MRNA剪接的“SnRNA-蛋白质复合体”的成熟有关。
卡哈尔体,是存在于细胞核里的细胞器。卡哈尔体是相当具保留性的核细胞器。到目前为止,在脊椎动物、果蝇、酵母菌,以及植物中均发现存在卡哈尔体。尽管卡哈尔体被发现已经100多年,卡哈尔体的确切功能还不是很明朗。初步证据显卡哈尔体可能与参与MRNA剪接的“SnRNA-蛋白质复合体”的成熟有关。
RNA聚合酶Ⅱ是一个蛋白质复合体。它是在真核生物细胞核中发现的三种RNA聚合酶酶之一。 它催化脱氧核糖核酸的转录,以合成MRNA的和大多数SnRNA和微RNA的前体。 RNA聚合酶Ⅱ是一个550 kDa的12个亚基复合物,是研究最多的RNA聚合酶类型。 它需要多种转录因子才能与上游基因启动子结合并开始转录。
RNA聚合酶Ⅱ是一个蛋白质复合体。它是在真核生物细胞核中发现的三种RNA聚合酶酶之一。 它催化脱氧核糖核酸的转录,以合成MRNA的和大多数SnRNA和微RNA的前体。 RNA聚合酶Ⅱ是一个550 kDa的12个亚基复合物,是研究最多的RNA聚合酶类型。 它需要多种转录因子才能与上游基因启动子结合并开始转录。
N-甲基腺苷是真核生物细胞MRNA中最常见的修饰,也见于TRNA、核糖体RNA、SnRNA和LncRNA等其他种RNA,细胞RNA中约有0.1%至0.4%的腺苷位点具有此修饰。m6A最早在1970年代即被发现,但未知其功能,近年随着其修饰酶、去修饰酶和识别蛋白的发现,其修饰机制与功能逐渐明朗。m6A是由一甲基转移酶复合体修饰,复合体包括METTL3、METTL14、WTAP、RBM15、KIAA1429与METTL5等,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到RNA的腺苷上;FTO基因蛋白与ALKBH5则为m6A去甲基酶,可移除RNA上m6A的甲基;具YTH结构域的蛋白、IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、FMR1和RBMX等蛋白可与mRNA上的m6A结合,为其识别蛋白,因蛋白种类和RNA序列而异可促进或抑制其转译、降解、RNA剪接等。研究m6A转录组的技术包括m6A测序、mRNA甲基化测序、m6A-CLIP与SCARLET等。有数种癌症与m6A修饰的异常有关。除真核生物外,许多RNA病毒也具有m6A修饰,可能与其感染、复制有关。
2'-O-甲基化是RNA一种常见的核苷修饰,为核苷中核糖2号位的氢氧基被甲基化而形成甲氧基,此修饰常见于核糖体RNA与SnRNA中与转译和剪接体功能相关的位点,且在MRNA、TRNA、SnoRNA与SiRNA中也有,域生物与病毒RNA的A、尿苷、胞苷、鸟苷四种碱基中皆有此修饰。目前哺乳类与酵母菌已有超过1200个2'-O-甲基化位点被发现,纪录于RMBase数据库中。有研究显示rRNA中的一些2'-O-甲基化位点为部分修饰,意即细胞中只有一部分rRNA在这些位点被修饰,可能是核糖体异质性的机制之一。