芽囊原虫属包含一些单细胞不等鞭毛类的寄生虫，一般在各种动物的胃肠道内生活造成芽囊原虫感染，在人类、牲畜、鸟类、鼠类、爬行类、两栖类、蟑螂体内都有分布。此虫对宿主选择性不高，因此有多个物种都可感染人类；按现有医学分类习惯，这些物种都可称作人芽囊原虫。
淡色藻门是不等鞭毛类的一大部分光合作用生物。它被分为两个亚门——Phaeista和Khakista。
Chrysoparadoxophyceae纲在两个亚门以外；还有另外一堆被综合为Subphylum Ochrophyta 地位未定这个临时名称的亚门级分类单元。
拟菌病毒科是核质巨DNA病毒的一个科，成员均为巨大病毒，包含拟菌病毒、Klosneuvirus、餐厅虫病毒、图邦病毒等，可能还包含许多目前被归在藻类去氧核糖核酸病毒科的病毒。本科病毒的天然宿主的范围甚广，包括变形虫、定鞭藻门、绿藻门、古虫界与不等鞭毛类等真核生物的不同类群，甚至可能包含能感染动物的Namao病毒，亦有在人体中被发现的纪录。
褐藻素是分子式为C42H58O6的叶黄素类，是褐藻纲的叶绿体中常见的色素，也存在在及大部分不等鞭毛类生物中，使其有褐色至绿色的色泽。褐藻素会吸收可见光谱中蓝绿色至黄绿色的光，最大吸收频率在510-525 nm，而在450至540 nm都有显著的吸收。
墨角藻目是褐藻纲之下的一个目分类单元，下领九个科。本目包括多个栖息于潮间带的大型藻类，大部分通过固定在坚硬的基质上而生长，例如：墨角藻、马尾藻等。作为褐藻纲的成员，墨角藻目如同其他褐藻纲物种同属不等鞭毛类生物的淡色藻门。褐藻纲的学名Phaeophyceae由古希腊语的phaios、phyton及纲级的后缀-ceae组成。这个纲包括有不少海洋里的巨型植物，但也包括一些体型较细少及构造精细的植物。
双环总门是不等鞭毛类之下的一个子类群。
SAR超类群又名HAR生物亚界，是一个真核生物分类单元，包括不等鞭毛类、囊泡虫类和有孔虫，“SAR”即为这三个分类单元的拉丁名称首字母组合。
SAR超类群又名HAR生物亚界，是一个真核生物分类单元，包括不等鞭毛类、囊泡虫类和有孔虫，“SAR”即为这三个分类单元的拉丁名称首字母组合。
SAR超类群又名HAR生物亚界，是一个真核生物分类单元，包括不等鞭毛类、囊泡虫类和有孔虫，“SAR”即为这三个分类单元的拉丁名称首字母组合。
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