中华基督教会基协中学，一所全日制津贴男女中文中学，于1963年创立。校舍位处东头村道161号，邻近黄大仙下邨，该校为一基督教学校，直属中华基督教会香港区会。
中华基督教会基元中学是中华基督教会香港区会于香港元朗区成立的一所津贴学校男女英文中学。坐落于元朗凤攸东街的一座连环型校舍，创校于1982年，建立目的是见证基督在元朗，并与附近的中华基督教会基朗中学为姊妹校，邻校为圣公会白约翰会督中学。
中华基督教会基朗中学是由中华基督教会香港区会主办的一所津贴学校男女文法中学，部分校舍与邻校圣公会白约翰会督中学并建共用，创校于1982年，建立目的是见证基督在元朗。基朗中学位于香港元朗凤攸南街8号，与中华基督教会基元中学为姊妹校。于2008－2009年度，基朗宣布逐渐转型为一间英文中学。
中华基督教会基理小学位于荃湾梨木树邨，办学团体是中华基督教会香港区会。学校于1975年创办，是全港首批三座兴建时为6层的“火柴盒”小学之一。及后，于1990年代结束营办，旧校址现在已经成为香港圣公会开办的圣公会主爱小学（梨木树）。
协和书院由中华基督教会香港区会管理，位于九龙蒲岗村道171号，是香港一所政府津贴男女中学，采用英语教学。该校学生在公开考试中成绩优异，在学术、体育及音乐方面均有杰出成就，是一所著名地区学校。
中华基督教会公理书院，又称公理书院，前名为中华基督教会香港区会公理书院，是昔日香港男女津贴中学，由中华基督教会香港区会于1967年创立及管理，校舍位于香港铜锣湾大坑径17号。学校在创校初期以私立实验中学模式办学，在1972年转为按额资助学校。随着政府于1978年实施普及教育，学校遂接受政府之邀请由1979年起分期转为津贴中学，直至1982年正式成为政府全津贴中学。学校在1999年9月易名为中华基督教会公理书院，2003年因搬迁到红磡土瓜湾新校舍并更名为中华基督教会基道中学而结束，共办学36年，原有校舍则成为中华基督教会公理高中书院，于2003年9月1日起开课。最后一任校长为周耀坚牧师，校监为余英岳牧师。
中华基督教会基新中学，是中华基督教会香港区会在粉岭所成立的一所政府津贴男女文法中学。校训：“学以致用”，社别分别有四色：仁、诚、勤、毅。
中华基督教会基法小学为一所直属中华基督教会香港区会的小学，于1965年成立。基法小学于2005年9月由观塘月华街旧校迁往油塘新校。学校采用小班教学，每级设6班，而每班平均有25名学生，AB班为精英班，平均有30名学生。
中华基督教会扶轮中学，香港一所全日制津贴男女中文中学，位于九龙黄大仙区龙翔道157号，是为基督教学校，直属中华基督教会香港区会，创办于1972年9月，因获九龙西区扶轮社慨捐巨款资助兴建，故以“扶轮”命名。
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