刺猬冠状病毒是乙型冠状病毒属的一种病毒，于2014年在德国的西欧刺猬粪便样本中被发现，基因组长约30000核碱基，在乙型冠状病毒属中，此病毒与中东呼吸症候群冠状病毒、扁颅蝠冠状病毒HKU4与伏翼蝠冠状病毒HKU5的关系较为接近，皆属Marbevirus亚属。除冠状病毒皆有的复制酶与四种结构蛋白外，此病毒还有ORF3a、ORF3b、ORF4a、ORF4b、ORF5、ORF8b等数种辅助蛋白，不过此病毒与MERS-CoV刺突蛋白中受体结合位序列的相似程度仅有约36%，显示两者可能使用不同的细胞受体进行感染。
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东北刺猬冠状病毒HKU31是乙型冠状病毒属的一种病毒，在中国的东北刺猬肠道样本中发现，于2019年由香港大学的研究团队发表。此病毒与感染西欧刺猬的刺猬冠状病毒关系接近，核苷酸序列相似度为79.6%，与中东呼吸症候群冠状病毒的核苷酸序列相似度则为68.4%，这些病毒与扁颅蝠冠状病毒HKU4与伏翼蝠冠状病毒HKU5皆属乙型冠状病毒属的Marbevirus亚属。
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