南京水利科学研究院是中华人民共和国的一所水利科学研究机构。前身是1935年成立的中央水工试验所。
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严恺，男，天津人，祖籍福州闽侯，中国水利工程专家、科学家、教育家，中国科学院院士、中国工程院院士、墨西哥科学院外籍院士，中国共产党党员、九三学社社员。曾任第三届全国人大代表、中共十大、十一大代表、中国水利学会名誉理事长、中国海洋学会名誉理事长、南京水利科学研究院名誉院长、河海大学名誉校长、博士生导师。
窦国仁，男，满族，辽宁北镇人，中华人民共和国泥沙及河流动力学专家。南京水利科学研究院名誉院长、高级工程师。
胡亚安，男，中国航运专家，水利部交通运输部国家能源局南京水利科学研究院教授级高级工程师，中国工程院院士。
张建云，男，江苏沛县人，中国水文水资源专家。曾任中华人民共和国水利部水文局总工程师、副局长兼总工程师。现任南京水利科学研究院院长。
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