座囊菌纲 编辑
座囊菌纲是子囊菌门盘菌亚门下的一纲，共包含11个目、90个科、1300个属及超过19000个种。传统上本纲的大多数真菌都被算作腔菌，不过现在这一分类已不被接受。本纲原先认为的一些传统的形态学特征现在发现并非是特殊的，目前的划分是基于DNA序列的比较进行的。
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曾氏菌科是子囊菌门座囊菌纲格孢菌目的一个科，为一单型的分类单元，其下仅包含曾氏菌属一个属，该属也仅有台湾曾氏菌一个物种，生长在虫生真菌巨针线形虫草的子实体上，外形与同目的茎点霉属真菌类似。2018年分子种系发生学研究将曾氏菌科发表为新科，目前仅知分布于台湾，为台湾特有种，模式产地为台湾南投县仁爱乡翠峰，正模标本保存于国立台湾大学植物病理与微生物学系。
曾氏菌科是子囊菌门座囊菌纲格孢菌目的一个科，为一单型的分类单元，其下仅包含曾氏菌属一个属，该属也仅有台湾曾氏菌一个物种，生长在虫生真菌巨针线形虫草的子实体上，外形与同目的茎点霉属真菌类似。2018年分子种系发生学研究将曾氏菌科发表为新科，目前仅知分布于台湾，为台湾特有种，模式产地为台湾南投县仁爱乡翠峰，正模标本保存于国立台湾大学植物病理与微生物学系。
小盾壳目为座囊菌纲的一科真菌。
尾孢菌属是一种子囊菌门座囊菌纲煤炱目球腔菌科真菌的属。本属的多个品种都是植物病理学，主要是令叶片出现斑点。相对于其他种属，本属已有多个品种被广泛研究，但其实还有无数品种未被描述、甚或发现。即使是已知的品种，它们的研究价值依然很高。
　
居杯菌科为座囊菌纲的一科真菌。未指定目。
广口盾壳科也称光口盾壳科，是座囊菌纲下的一个科，未指定目。
座囊菌亚纲是子囊菌门座囊菌纲下的亚纲，共包含座囊菌目、多腔菌目、煤炱目三个目。本亚纲真菌的子囊之间缺乏侧丝、拟侧丝或类侧丝。
座囊菌目，是座囊菌纲下的一个目。
格孢菌亚纲是子囊菌门座囊菌纲下的亚纲，共包括纵裂菌目、Jahnulales、Mytilinidiales、格孢菌目四个目。这一亚纲的一大重要特征是该亚纲真菌的子囊间存在着拟侧丝。拟侧丝是一种从子囊座中心顶部向下生长并在基部与细胞融合的不孕性丝状体。
格孢菌目，是座囊菌纲下的一个目。