微茎科为斜睾目的一个科。此科的模式属为微茎属。
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马蹄吸虫属为吸虫纲复殖亚纲斜睾目之下的一个属。本属的科，传统来说被划归微茎科，但近年有文献指本属应该独立出来自成一科。本属最初为Nikoll于1907年从雀鸟身上发现。本属物种一般都会感染鸟类，但亦有几种转变宿主，变为感染哺乳类动物，例如：稻大鼠。有多个物种被发现以招潮属的大西洋砂招潮作为中间宿主。
微小奥拿吸虫为微茎科奥拿属的动物。在中国大陆，分布于广西北海市、广东湛江市等地，营寄生生活，寄生在肠脏。
巨卵马蹄吸虫为微茎科马蹄属的动物。在中国大陆，分布于广东省湛江市、广西壮族自治区北海市等地，营寄生生活，寄生在肠。
娇美马蹄吸虫为微茎科马蹄属的动物。分布于全球性以及中国大陆的广东湛江市等地，营寄生生活，终末宿主包括有鸥、鹬等各种鸟类以及寄生在肠道。
对茎马蹄吸虫为微茎科马蹄属的动物。分布于俄罗斯、欧洲、美洲以及中国大陆的广西壮族治区灵川县等地，营寄生生活，终末宿主鱼类、小翠鸟等以及寄生在肠腔。
小微茎吸虫为微茎科微茎属的动物。分布于日本以及中国大陆的上海等地，营寄生生活，宿主小狗、小白鼠与猫以及寄生在肠。
小马蹄吸虫为微茎科马蹄属的动物。在中国大陆，分布于广西壮族自治区北海市等地，营寄生生活，寄生在肠。该物种的模式产地在广西壮族自治区北海市。
巨咽马蹄吸虫为微茎科马蹄属的动物。在中国大陆，分布于广西壮族自治区北海市等地，营寄生生活，寄生在肠。该物种的模式产地在广西壮族自治区北海市。
壮乳头马蹄吸虫为微茎科马蹄属的动物。在中国大陆，分布于广西壮族自治区北海市等地，营寄生生活，寄生在肠部。该物种的模式产地在广西壮族自治区北海市。
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