井杆菌属是拟杆菌目下的一个属。本属惟一种蓝孔井杆菌采自西沙群岛永乐环礁的海洋蓝洞“三沙永乐龙洞”中。
海滑菌科为拟杆菌目的一个科。此科的模式属为海滑菌属。
弯曲海菌属，也称屈曲海生菌属，是拟杆菌目下的一个属。
拟杆菌科 为拟杆菌目的一科细菌。此科的模式属为拟杆菌属。
文肯菌属为拟杆菌目文肯菌科的一属厌氧革兰氏阴性菌。小杆菌。分离于牛、鸡和日本鹑的粪或盲肠标本。此属的模式种为小梭文肯菌。
普雷沃氏菌属为拟杆菌目普雷沃氏菌科的一属厌氧革兰氏阴性菌。多形态杆菌，不产芽孢。该属是由口腔拟杆菌的16个种转入组成的新属。此属的模式种为产黑普雷沃氏菌。
醋热菌属为拟杆菌目拟杆菌科的一属厌氧革兰氏阴性直杆菌。分离于在60℃左右的污物消化液。此属的模式种也是唯一种为少食醋热菌。
孙修勤菌属是拟杆菌目下的一个属。本属以微生物学家孙修勤的名字命名。
线形醋菌属为拟杆菌目拟杆菌科的一属厌氧革兰氏阴性菌。直杆、弯杆和螺杆菌。此属的模式种也是惟一种为坚实线形醋菌。
口腔杆菌属为拟杆菌目紫单胞菌科的一属厌氧革兰氏阴性杆菌。分离于患牙根炎和牙周炎的人及健康人的牙缝。此属的模式种且是唯一种为卡氏口腔杆菌。
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