核定位序列 - The mini wiki

PABPN1全名为多聚腺苷酸结合核蛋白1，在人类基因组中由14号染色体编码，是一种多聚腺苷酸结合蛋白。此蛋白位于细胞核中，其N端有一卷曲螺旋结构域，中间为RNA识别基序，C端则有核定位序列。在mRNA转录结束后即参与多腺苷酸化的反应，以N端与多聚腺苷酸聚合酶结合，并以RRM与刚生成的多腺苷酸尾结合以促进多腺苷酸化进行，且可抑制细胞在较靠近终止密码子的多腺苷酸化讯号以切割和聚腺苷酸特异性因子切割mRNA并加上多腺苷酸尾，促使其使用距离较远的多腺苷酸化讯号，因而形成较长的3'非转译区。

Rev是人类免疫缺陷病毒基因组表达的一个早期蛋白，对调控HIV蛋白的表达有重要作用。Rev蛋白上存在核定位序列使其可以输入到细胞核，最终使未剪切的或不完全剪切的mRNA输出细胞核。在Rev缺失的情况下，HIV-1的晚期mRNAs会被束缚在细胞核内，无法被转录。

Kruppel样因子4或肠富集Krüppel样因子是锌指转录因子KLF家族的一个成员，后者属于一个较大的SP1样转录因子家族。KLF4参与细胞增殖、细胞分化、细胞凋亡和体细胞重编程的调节。有证据表明KLF4在包括大肠癌在内的一些癌症中是肿瘤抑制基因。与KLF2类似，它在C端有三个C2H2型锌指。它有两个核定位序列指引它定位于细胞核内。在胚胎干细胞和间充质干细胞中KLF4是显示多能化的很好标记。

核输出序列又称作核输出信号是由四个疏水氨基酸残基组成的蛋白质肽段序列，能将蛋白从细胞核通过核孔复合体核运输到细胞质。与之功能相反的是能将蛋白运入细胞核的核定位序列。NES可以被外输蛋白识别并结合。由生物信息学分析发现NES疏水性残基的最常见间隔为LxxxLxxLxL，其中“L”是疏水性残基，“x”则是任何其它氨基酸。这些疏水性残基的间距可以通过检查含有NES的已知结构来解释，因为关键残基通常位于蛋白质内的相邻二级结构的相同面中，这允许它们与输出蛋白相互作用。
此外，由于核糖核酸仅由核苷酸组成，因此它缺乏核出口信号来移出核。故大多数形式的RNA将结合蛋白质分子，来形成能从核中输出的核糖核蛋白复合物。