真细菌目为梭菌纲的一目细菌。此目细菌的模式属为真细菌属。
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梭菌纲是厚壁菌门的一类厌氧的细菌。该纲的模式目为梭菌目。
瘤胃菌科是梭菌纲梭菌目的一个科。本科的类群皆为专性厌氧菌，形状各异，有些呈杆菌，有些则为球菌。
毛螺菌属为梭菌目毛螺菌科的一属厌氧革兰氏阴性弯杆菌。分离于小牛瘤胃中。此属的模式种为多对毛螺菌。
互营球菌属为梭菌目毛螺菌科的一属严格厌氧的革兰氏阴性球菌。分离于干草饲养的牛的瘤胃中。此属的模式种为糖变互营球菌。
嗜热分支杆菌属为梭菌目梭菌科的一属革兰氏阳性菌。栖息于人为产生的热环境和地热环境，也生活在mesobiotic淡水沉积物中。此属的模式种为快生嗜热分支杆菌。
毛螺菌科是梭菌目的一个科，主要在人类和哺乳动物肠道菌群中。 该科的所有种均为厌氧生物。 该科成员通过产生丁酸可以预防人类大肠癌 。 已经发现，毛螺菌科会导致无菌小鼠发生糖尿病。
粪球菌属为梭菌目毛螺菌科的一属革兰氏阳性菌。分离于人的肠道和粪便。此属的模式种为。
罗斯氏菌属为梭菌目毛螺菌科的一属革兰氏阴性菌，微弯杆，分离于鼠的盲肠，以美国口腔微生物学家西奥多·罗斯伯里的姓氏命名。此属的模式种为盲肠罗斯氏菌。
丁酸梭菌又称丁酸菌、酪酸梭菌、酪酸菌、宫入菌。梭菌目梭菌科梭菌属的一种细菌。
叶瘿菌属是梭菌目下的一个属。科的地位未定。属下只有巴尔涅斯孪生球菌 Gallicola barnesae Ezaki et al., 2001一种。
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