水源校区遗址,位于台湾台北市中正区新店溪岸边。因国立台湾大学人类学系由校总区搬至该校区而于卓越二期工程施工时发现。由国立台湾大学执行发掘。共发掘过两次,第一次为2013年,第二次为2017年。首次发掘于国防医学院护理系馆及药学系馆基地发掘七个探坑,确认包含十三行文化层、清代农田及台湾日治时期建筑地基。第二次发掘于同地点,为抢救发掘。由碳定年确认十三行文化层在BP1200-1000之间。2017抢救发掘出土遗物包括陶器、石器、铁器、玻璃珠与兽骨等等,另外也将2017年试掘出土日治时期遗构几乎清开。
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