中华人民共和国深圳海关的前身为九龙关,创建于1887年。1949年10月中华人民共和国成立后,原来总部位于香港九龙半岛的中华民国九龙海关全体人员转投中国大陆,即于当时的广东省宝安县设立海关,更名为中华人民共和国九龙海关。1988年3月,当时的九龙海关率先实行报关电脑自动化工程,使入出境旅客行李物品的验放速度大大提高。1997年香港回归后,改名为中华人民共和国深圳海关,管辖深圳市和惠州市两地。目前,共有在职干部职工8000余人,设有53个机构,其中副厅级机构2个,正处级机构52个;内设职能处室21个,下设隶属海关32个。深圳口岸业务量大,海、陆、空、铁、邮监管门类齐全,各项业务规模均居全国海关前列。
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马忠源,上海市人,中华人民共和国政治人物,早年供职于上海海关、深圳海关,后任深圳海关副关长兼政治部主任,2006年担任重庆海关党组书记、关长,2008年起担任全国人大代表,2011年1月,补选为全国人大代表[. 人民网. [2012-09-18]. .
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