源真核生物界，也称作古真核生物界，是汤玛斯·卡弗利尔-史密斯提出的一个界，包括了粒线体出现以前的真核生物的所有后代物种. 源真核生物曾被认为还没有获得线粒体和典型的高尔基体，核糖体仍与原核生物相似是70S型，是当时所认为的最原始的真核生物类群。这一概念包括了pelobionts与entamoebids , 锐滴虫, 微孢子虫等. 这一类群在真核生物的RRNA进化树上位于底部. 但是，现在已知这个类群的所有物种都是从具有线粒体的祖先进化而来。基于其它基因的进化树不支持这一类群处于底部的观点。因此，源真核生物界这一概念被废弃了。
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