系统发生树 编辑
系统发生树又称为种系发生树、亲缘关系树，或演化树，是一种呈现不同物种或是同物种不同族群的个体之间亲缘关系的树状图。分析个体亲缘关系的学术领域称为系统发生学，可应用于多个领域的研究，如支序分类学、流行病学，以及生态学。地球上所有生命都是一个系统发生树的一部分，表明有共同起源。
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基因组岛是指一个基因组中，有证据显示可能来源于基因水平转移的一段。这一术语通常用于描述微生物学，特别是细菌的基因组。GI中的基因可以编码多种功能的蛋白质，可以参与细菌共生或病理过程，并且可以帮助微生物适应环境。例如，和病原微生物发病机制相关的GI通常被称为致病岛，带有许多抗生素抗生素抗药性的GIs通常被称作抗生素抗药性岛。相同的GI可以通过各种基因水平转移方式而出现在亲缘关系较远的微生物基因组中，这使得科学家可以通过碱基CG含量比的不同，以及系统发生树分析找出基因组岛。
分支图，也作支序图，是指支序分类学中用于展示生命体互相之间的关系的图表。不过，分支图并不是系统发生树，因为分支图既不展示生物与其祖先的关系，也不展示生物的演化过程。不过，从一副分支图中可以推导出许多进化树图。分支图使用线条来表达一组拥有最近共同祖先的生物，这些线条各自分离至不同的方向，最后形成不同的演化支。分支图可以有许多不同的形状，但它们都有树状图的结构，沿着每一条线都能走到它们与其他线条分离的地方。这些分离的节点代表一个假定存在的祖先，这些假定存在的祖先会拥有其末端分类元所拥有的特性，能够暗示进化的过程。虽然传统上这些分支图依照生物的外形特征绘制，不过近年来科学界也在使用脱氧核糖核酸和核糖核酸序列数据、计算系统发生学生成分支图。
支序分类学又称支序系统学、分支系统学、系统发育系统学，简称支序学，是一门基于系统发生的生物分类学学科，主张通过对共有衍生性状相似性的分析，推导出分类单元之间的分化关系，进而构建系统发生树，以形成严格的单系分类系统。“支序”意为演化支的序列，或演化支的分化次序。
分子系统发生学是分析遗传分子差异的系统发生学的一个分支，以获得有机体进化关系的信息。分子系统发生学分析的结果在系统发生树中表达。分子系统发生学是分子系统分类学的一个方面，更广泛的术语还包括在生物分类学和生物地理学中使用分子数据。
支序分类学又称支序系统学、分支系统学、系统发育系统学，简称支序学，是一门基于系统发生的生物分类学学科，主张通过对共有衍生性状相似性的分析，推导出分类单元之间的分化关系，进而构建系统发生树，以形成严格的单系分类系统。“支序”意为演化支的序列，或演化支的分化次序。
支序分类学又称支序系统学、分支系统学、系统发育系统学，简称支序学，是一门基于系统发生的生物分类学学科，主张通过对共有衍生性状相似性的分析，推导出分类单元之间的分化关系，进而构建系统发生树，以形成严格的单系分类系统。“支序”意为演化支的序列，或演化支的分化次序。
支序分类学又称支序系统学、分支系统学、系统发育系统学，简称支序学，是一门基于系统发生的生物分类学学科，主张通过对共有衍生性状相似性的分析，推导出分类单元之间的分化关系，进而构建系统发生树，以形成严格的单系分类系统。“支序”意为演化支的序列，或演化支的分化次序。
历史语言学中，树模型或树状模型、发生模型、分类模型是与谱系图相似的语言演化模型，尤其与物种演化的系统发生树相似。有同一共同祖先的语言属于同一个语系。
支序分类学又称支序系统学、分支系统学、系统发育系统学，简称支序学，是一门基于系统发生的生物分类学学科，主张通过对共有衍生性状相似性的分析，推导出分类单元之间的分化关系，进而构建系统发生树，以形成严格的单系分类系统。“支序”意为演化支的序列，或演化支的分化次序。
分支图，也作支序图，是指支序分类学中用于展示生命体互相之间的关系的图表。不过，分支图并不是系统发生树，因为分支图既不展示生物与其祖先的关系，也不展示生物的演化过程。不过，从一副分支图中可以推导出许多进化树图。分支图使用线条来表达一组拥有最近共同祖先的生物，这些线条各自分离至不同的方向，最后形成不同的演化支。分支图可以有许多不同的形状，但它们都有树状图的结构，沿着每一条线都能走到它们与其他线条分离的地方。这些分离的节点代表一个假定存在的祖先，这些假定存在的祖先会拥有其末端分类元所拥有的特性，能够暗示进化的过程。虽然传统上这些分支图依照生物的外形特征绘制，不过近年来科学界也在使用脱氧核糖核酸和核糖核酸序列数据、计算系统发生学生成分支图。