结构模体 编辑
结构模体也称结构基序,是链样生物分子中普遍存在且具有特征性的局部三维结构单元模式。结构模体常为某种功能决定部位,可出现在各种不同的、演化上不相关的链样分子中。结构模体使得我们无法预测蛋白的生物学功能:不同蛋白质或酶中的相同模体可能存在较大功能差异。
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碱性螺旋-环-螺旋是表征一种转录因子家族的蛋白质结构模体
锌指,又称锌手指,是一种小的蛋白质结构模体,其特征在于配合物一个或多个锌离子以稳定折叠。最初用来描述非洲爪蟾卵母细胞转录因子IIIA假说结构的手指状外观,锌指名称现在已经包含了各种不同的蛋白质结构。 在1983年,非洲爪蟾TFIIIA最初被证明含有锌,并且需要这种金属才能运行,这是被报道的第一个基因调节蛋白中具有锌的要求。
亮氨酸拉链是蛋白质中一种常见的三维结构模体,常见于许多转录因子的DNA结合结构域,因此涉及基因的表达调控。亮氨酸拉链在真核生物和原核生物的蛋白中都有发现,但以真核生物居多。
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锌指,又称锌手指,是一种小的蛋白质结构模体,其特征在于配合物一个或多个锌离子以稳定折叠。最初用来描述非洲爪蟾卵母细胞转录因子IIIA假说结构的手指状外观,锌指名称现在已经包含了各种不同的蛋白质结构。 在1983年,非洲爪蟾TFIIIA最初被证明含有锌,并且需要这种金属才能运行,这是被报道的第一个基因调节蛋白中具有锌的要求。
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富含白胺酸重复序列,亦称富亮氨酸重复或白胺酸多重复,是一种α/β 马蹄形折叠形式的蛋白质结构模体,由20–30个疏水性氨基酸残基组成。这些重复通常会折叠到一起,形成一种螺线管状的蛋白质结构域,称为富亮氨酸重复结构域。典型的富亮氨酸重复中,每一个重复单元都有一个β折叠-转角-α螺旋结构,其形成的结构域包含许多这样的重复,并组成一个马蹄状结构,α螺旋在其外侧,β折叠在其内侧平行分布。β折叠的一面与α螺旋的一侧与外界的溶剂相接触,因此主要为亲水性氨基酸残基。α螺旋与β折叠之间的区域为蛋白的疏水效应,位阻效应且富含亮氨酸残基。