茎环 编辑
茎环指一种分子内碱基配对方式,与因此形成的结构,可发生于单股DNA,但在RNA分子中较为常见。当形成的循环较小时,也称为发夹或发夹环。
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细菌小RNA泛指细菌中长50至500核碱基的非编码RNA,通常具有许多茎环等结构,在大肠杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、黄单胞菌、根瘤菌与蓝绿菌等常见细菌中均有发现。最早发现的细菌小RNA为1984年在大肠杆菌中发现的MicF RNA,可抑制外膜蛋白ompF之mRNA的转译,并使其mRNA被降解,不久后又在金黄色葡萄球菌发现了另一种小RNARNAIII,可影响其毒素的合成与释放。目前已有超过6000种细菌小RNA经RNA测序等技术被发现。
SECIS元件全称为硒半胱氨酸插入序列,是生物MRNA中一个长约60核碱基的RNA元件,次级结构为一茎环 ,此元件会使核糖体转译时不将UGA当作终止密码子,而将其作为编码特殊氨基酸硒半胱氨酸的密码子,因此为编码硒蛋白的mRNA所需。域生物皆有SECIS元件,虽皆为茎环结构,但彼此序列差异很大,细菌的SECIS元件通常紧跟在UGA密码子之后,真核生物与古菌的SECIS元件则位于mRNA的3'非转译区,可使mRNA中多于一个UGA密码子编码硒半胱氨酸,另外已知甲烷球菌属的一种古菌具有位于5'非转译区的SECIS元件。真核生物的SECIS元件通常有特殊的腺嘌呤:鸟嘌呤碱基配对,可能对其功能相当重要。SECIS元件结合蛋白2可与SECIS元件结合以促进UGA密码子编码硒半胱氨酸,并可避免mRNA被无义介导的mRNA降解途径降解移除。
SECIS元件全称为硒半胱氨酸插入序列,是生物MRNA中一个长约60核碱基的RNA元件,次级结构为一茎环 ,此元件会使核糖体转译时不将UGA当作终止密码子,而将其作为编码特殊氨基酸硒半胱氨酸的密码子,因此为编码硒蛋白的mRNA所需。域生物皆有SECIS元件,虽皆为茎环结构,但彼此序列差异很大,细菌的SECIS元件通常紧跟在UGA密码子之后,真核生物与古菌的SECIS元件则位于mRNA的3'非转译区,可使mRNA中多于一个UGA密码子编码硒半胱氨酸,另外已知甲烷球菌属的一种古菌具有位于5'非转译区的SECIS元件。真核生物的SECIS元件通常有特殊的腺嘌呤:鸟嘌呤碱基配对,可能对其功能相当重要。SECIS元件结合蛋白2可与SECIS元件结合以促进UGA密码子编码硒半胱氨酸,并可避免mRNA被无义介导的mRNA降解途径降解移除。
假结结构是一类核酸三级结构。假结结构包含至少两个茎环。其中,一个茎环结构的茎的一半插入了另一个茎环结构的茎结构中。假结结构最初于1982年在芜青花叶病毒中发现。假结结构折叠成类似于绳结的三维结构,但却并不是真正的拓扑学的结。
假结结构是一类核酸三级结构。假结结构包含至少两个茎环。其中,一个茎环结构的茎的一半插入了另一个茎环结构的茎结构中。假结结构最初于1982年在芜青花叶病毒中发现。假结结构折叠成类似于绳结的三维结构,但却并不是真正的拓扑学的结。
SECIS元件全称为硒半胱氨酸插入序列,是生物MRNA中一个长约60核碱基的RNA元件,次级结构为一茎环 ,此元件会使核糖体转译时不将UGA当作终止密码子,而将其作为编码特殊氨基酸硒半胱氨酸的密码子,因此为编码硒蛋白的mRNA所需。域生物皆有SECIS元件,虽皆为茎环结构,但彼此序列差异很大,细菌的SECIS元件通常紧跟在UGA密码子之后,真核生物与古菌的SECIS元件则位于mRNA的3'非转译区,可使mRNA中多于一个UGA密码子编码硒半胱氨酸,另外已知甲烷球菌属的一种古菌具有位于5'非转译区的SECIS元件。真核生物的SECIS元件通常有特殊的腺嘌呤:鸟嘌呤碱基配对,可能对其功能相当重要。SECIS元件结合蛋白2可与SECIS元件结合以促进UGA密码子编码硒半胱氨酸,并可避免mRNA被无义介导的mRNA降解途径降解移除。