竹溪寺位于台湾台南市南区，为台湾府城七寺八庙之一，也是台南四大古刹之一。该寺属于禅宗临济宗，于正殿供奉释迦牟尼佛、药师佛与阿弥陀佛三宝佛。其所在地邻近竹溪，古名桶盘浅。庙中有号称台南三大名匾之一的“然世界”匾。此外在台湾日治时期的西来庵事件发生后，台南西来庵虽然遭到拆毁，但原本在庵内供奉的五福王爷神像被寺僧带到寺中供奉。
葫芦寺，全名财团法人台北市葫芦寺，位于台北市士林区社子岛延平北路五段285巷35号，为台湾民间信仰的观音寺。主祀观音菩萨，配祀济公活佛、瑶池金母、天上圣母、关圣帝君、福德正神、文昌帝君、药师佛、武财神、文财神、注生娘娘、月下老人等神佛。
广胜下寺壁画有四铺藏于美国。前殿两铺为明代壁画，后殿两铺为元代作品。壁画原来的位置在中国山西省洪洞县广胜下寺前殿、后殿的东、西山墙。据考证，前殿、后殿壁画的内容都是药师佛佛会图、炽盛光佛佛会图各一。1928年，为筹资修缮寺庙建筑，僧人、乡绅以1,600银洋的价格出售壁画。前殿的两铺壁画后来转卖给宾夕法尼亚大学考古学及古人类学博物馆，后殿炽盛光佛佛会图被纳尔逊-阿特金斯艺术博物馆收藏，后殿药师佛佛会图入藏大都会博物馆。据考证，前殿药师佛佛会图部分残片现藏法国吉美博物馆。广胜下寺后殿东山墙左上角还有一小部分壁画未被揭走，修缮时工作人员发现后殿北壁也残留有元代壁画。
宝檀华菩萨，或作宝昙华菩萨，东方净土琉璃世界的八大菩萨之一，与等文殊、观音、势至、无尽意、药王菩萨、药上菩萨、弥勒菩萨等菩萨一同，护持修行东方净土法门的居士、行者，在一些平常愿生阿弥陀佛西方净土却心不定，后来听闻药师佛佛号的善根具足者，临命终时，终究将接引到净土。也有人是转生于天人的。
安房国分寺 ，是位于千叶县馆山市国分的真言宗智山派的佛寺。山号是日色山，本尊为药师佛。
日光菩萨，又称日光遍照菩萨、日光普照菩萨或日曜菩萨，药师佛的左方胁侍，与右方胁侍月光菩萨在东方净琉璃世界中，与药师佛并称东方三圣，是该佛国中无量菩萨众的上首菩萨。
福州开元寺位于福建省福州市鼓楼区，俗称铁佛寺。是福州现存最古老寺院，始建于梁太清三年，距今近1500年历史。是著名的药师佛道场。
十二药叉大将，是佛教的护法神，主要记载在《药师经》，是守护修持药师佛法门众生的十二位药叉。
日光菩萨，又称日光遍照菩萨、日光普照菩萨或日曜菩萨，药师佛的左方胁侍，与右方胁侍月光菩萨在东方净琉璃世界中，与药师佛并称东方三圣，是该佛国中无量菩萨众的上首菩萨。
月光菩萨，又称月光遍照菩萨、月净菩萨或月光普照菩萨，出现于大乘佛教经典的人物，最早见于《佛说决定毘尼经》。比较为人熟知为药师佛的右胁侍，净琉璃世界的东方三圣之一。
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