蛋白质家族 - The mini wiki

多梳家族蛋白是在果蝇中首次发现的能够重塑染色质从而使基因在表观遗传上沉默的一类蛋白质家族。多梳家族蛋白因其可在黑腹果蝇的胚胎发育过程中通过调整染色质结构沉默同源异形基因而著名。

鸟苷酸结合蛋白是一类可被干扰素-γ诱导的GTP酶蛋白质家族，是三种干扰素诱导GTP酶家族之一，另外两种分别是分子量约47kDa的免疫相关鸟苷三磷酸酶家族成员包括干扰素诱导GTP酶5和免疫相关GTP酶家族M蛋白；以及MX蛋白家族，成员包括MX1和MX2，在人类基因组中，总共有7个GBP基因，参与抗微生物和病毒病原体的免疫系统。在结构上，hGBP1包含两个结构域，一个致密球状的N-末端结构域，用于执行GTP酶功能，另一个是Α螺旋组成的手指状C-末端结构域。

单胺氧化酶，EC编号 1.4.3.4，是催化单胺类物质氧化脱氨反应的酶。单胺氧化酶存在于细胞的线粒体外膜上，在人体内分布极广，尤以肝、脑及肾等组织细胞内的含量最高。由于需要黄素腺嘌呤二核苷酸作辅因子，因此它属于黄素蛋白或含黄素胺氧化酶蛋白质家族。

蛋白质超家族是对可以找到共同祖先的最大一组蛋白质的合称。一般而言，共同祖先是基于结构比对和物理性质得出的，即使序列相似性不高，也可能会具有共同祖先。蛋白质超家族中往往还会有内部联系相对更近的蛋白质家族。

DOCK蛋白家族是一类涉及细胞内细胞信号传送的蛋白质家族。DOCK家族的蛋白带有RhoGEF结构域，是一种鸟苷酸交换因子，可促使Rho家族的一些小G蛋白释放二磷酸鸟苷结合三磷酸鸟苷，从而使Rho家族蛋白激活。

胱天蛋白酶是一类半胱氨酸蛋白酶的统称。通常半胱天冬酶以酶原的形式合成，称为半胱天冬酶原。在人类基因组中，这个蛋白质家族已知包含至少有12个成员，它们参与细胞凋亡、发育生物学、坏死、炎症等许多重要的生理过程。其英文名称“Caspases”来自于半胱氨酸、天冬氨酸，和蛋白酶的字母缩写。 caspase是一种少见的非常专一的蛋白酶，它们发挥功能时会特异性地进攻蛋白质中的半胱氨酸残基和切断天冬氨酸残基后面的肽键。半胱天冬酶家族的成员于1990年代其陆续被发现，之后对半胱天冬酶的研究持续成为热点，因为细胞凋亡的异常是造成肿瘤、阿兹海默病等严重病症的一个主因。

BLOSUM打分矩阵是一种在生物信息学中用于序列比对的氨基酸替换打分矩阵。BLOSUM 是“blocks substitution matrix”的缩写。它是目前常用的一种氨基酸替换打分矩阵。BLOSUM打分矩阵最早由 Steven Henikoff. 和 J.G Henikoff在他们的论文中被提出。其中，他们从BLOCKS数据库中对那些在高度保守序列中的蛋白质家族进行观察测量进而整理出了氨基酸替换的概率。他们继续使用对数胜算来计算矩阵中的分值。与PAM打分矩阵相比，BLOSUM打分矩阵的内容皆由观察得出。在实际运用中，BLOSUM矩阵通常能获得更好的结果。

半胱氨酸环受体是一个配体门控离子通道蛋白质家族，包括有Γ-氨基丁酸受体、血清素受体、甘氨酸受体、烟碱型乙酰胆碱受体、锌激活离子通道等，通常由五个蛋白质亚基组成，五个亚基环状排列，形成一个中央孔道可使离子通过。其名称来自于序列中的13个保守的氨基酸，两端为两个半胱氨酸，由二硫键连接。

胱天蛋白酶是一类半胱氨酸蛋白酶的统称。通常半胱天冬酶以酶原的形式合成，称为半胱天冬酶原。在人类基因组中，这个蛋白质家族已知包含至少有12个成员，它们参与细胞凋亡、发育生物学、坏死、炎症等许多重要的生理过程。其英文名称“Caspases”来自于半胱氨酸、天冬氨酸，和蛋白酶的字母缩写。 caspase是一种少见的非常专一的蛋白酶，它们发挥功能时会特异性地进攻蛋白质中的半胱氨酸残基和切断天冬氨酸残基后面的肽键。半胱天冬酶家族的成员于1990年代其陆续被发现，之后对半胱天冬酶的研究持续成为热点，因为细胞凋亡的异常是造成肿瘤、阿兹海默病等严重病症的一个主因。

成纤维细胞生长因子为一个庞大的生长因子蛋白质家族。无脊椎动物以及脊椎动物体内都已发现FGF的存在。FGF在脊椎动物之间具有很强保守性，脊椎动物中已发现FGF家族的22个蛋白质，其分子量介于17到34原子质量单位之间。FGF与其受体成纤维细胞生长因子受体FGFR之间的作用需要靠肝素激活。