首都医科大学附属北京儿童医院位于北京市西城区南礼士路56号，是三级甲等综合性儿科医院。医院同时承担首都医科大学儿科医学院的任务，2017年成为国家儿童医学中心。医院总占地面积7万平方米，建筑面积12万平方米，编制病床970张，年门诊量300余万人次，住院病人7万余人次，手术逾2.3万例。医院将在通州区台湖镇总部基地附近建立新址。
李红良，男，中国生物学家，武汉大学教授，长江学者特聘教授。现任武汉大学基础医学院院长、武汉大学模式动物研究所所长。2018年，他被武汉大学千人计划专家霍文哲实名举报涉嫌学术造假，而武汉大学未对其进行处理。2019年11月，他被首都医科大学校长饶毅实名举报造假。
首都医科大学附属北京中医医院是一家三级甲等医院，医院承担首都医科大学中医药临床医学院的任务。医院位于东城区美术馆后街23号，于1956年建立。
首都医科大学宣武医院，创立于1958年，是一所三级甲等医院综合医院，是首都医科大学第一临床医学院。医院以神经科学和老年医学为重点，以治疗心脑血管疾患为主要特色。医院位于西城区广安门内街道长椿街45号。
徐群渊，男，江苏武进人，中国神经科学家，曾任首都医科大学校长、教授、博士生导师，中国神经科学学会副理事长，中国解剖学会理事长、名誉理事长。
首都医科大学附属北京中医医院是一家三级甲等医院，医院承担首都医科大学中医药临床医学院的任务。医院位于东城区美术馆后街23号，于1956年建立。
首都医科大学附属北京世纪坛医院，位于北京市海淀区羊坊店街道铁医路10号，是首都医科大学附属的一所三级甲等医院综合医院，同时也是首都医科大学肿瘤医学院，北京大学第九临床医学院。
尚永丰，中国生物化学与分子生物学家，中共党员，1964年生于甘肃通渭，曾任先后担任天津医科大学和首都医科大学校长、党委副书记。1986年毕业于甘肃农业大学兽医系，1989年在中国兽药监察所获硕士学位，1999年在美国宾夕法尼亚州立大学获博士学位，1999至2002年在美国哈佛大学进行博士后工作。2001年至2002年被哈佛大学医学院聘为讲师；2002年至2011年任北京大学基础医学院教授、生物化学与分子生物学系主任、博士生导师、北京大学医学部肿瘤中心副主任、长江学者等职务。2009年当选为中国科学院院士。2011年8月至2016年12月任天津医科大学校长、党委副书记。2016年10月至2019年6月任首都医科大学校长、党委副书记。2019年6月后调回北京大学工作。
金有豫，男，山东济南人，中国药理学家，曾任首都医科大学教授，中国药理学会副秘书长，药典委员会委员。
首都医科大学附属北京潞河医院，是中国首都医科大学附属的一所三级丙等综合医院。为北京市本科医师培训基地、北京市全科医师培训基地、区域疑难重症治疗中心、会诊中心、急救中心、卫生部临床路径试点医院、优质护理服务试点医院、数字化试点医院。
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