新疆维吾尔自治区自古就有人类活动的迹象,为中亚诸多民族活动的场所。新疆最早的居民是属塞迦,后受汉人、突厥人及回鹘人压力,只分布于中亚,其代表性民族是斯基泰人。他们发展出发达的游牧文化。公元前1世纪新疆被纳入匈奴的版图,成为首个统治新疆的非本地势力。及后汉朝和匈奴不断争夺新疆统治权。汉宣帝神爵二年,汉廷在龟兹建立西域都护府,使得今日新疆地区各国首次在名义上处于中原王朝的附属国的地位,但维持不久。6世纪后,新疆人种和语言逐渐回鹘化。11世纪后,因为伊斯兰教的传播开始出现穆斯林民族;而11世纪后新疆开始伊斯兰化后
,经历过一系列大大小小国家政权统治,18世纪中叶以后分别归属于清朝和中华民国,现在则属于中华人民共和国的新疆维吾尔自治区。
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新疆省人民政府是今新疆维吾尔自治区人民政府的前身,是中国共产党在新疆省建立的省政府,亦是中华人民共和国中华人民共和国治疆历史的肇始。