阿勒泰站，位于中华人民共和国新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州阿勒泰地区阿勒泰市，是北阿铁路上的火车站，于2017年6月10日启用，车站站房整体工程预计2017年9月完工启用，由乌鲁木齐铁路局奎屯车务段管辖。
叶城站，位于中华人民共和国新疆维吾尔自治区喀什地区叶城县，是喀和铁路上的火车站，2011年6月20日启用，现由乌鲁木齐铁路局喀什车务段管辖。
哈密站位于新疆维吾尔自治区哈密市伊州区天山北路，建于1959年，是兰新铁路和兰新高铁的一个铁路车站。距离兰州站1,339公里，距上行车站红光站11公里，距下行车站火石泉站13公里。该站隶属乌鲁木齐铁路局。2012年哈密站开始改造，位于距离直线约7公里，公路路程约13公里，在本站的西南方向，哈密货车南环线的哈密南站成为临时客运站，直至2014年11月19日哈密站重新启用。
包家店站是位于新疆维吾尔自治区玛纳斯县包家店镇的一个铁路车站，邮政编码832205。车站成立于2004年6月25日，有北疆铁路经过该站，现仅办理货运，不办理客运业务，车站及其上下行区间均为电气化区段。车站距离乌鲁木齐站121公里，隶属乌鲁木齐铁路局，是五等站，有2股道，为单线半自动闭塞方式办理接发列车，主要担负着列车会让业务。由于乌精二线修双线，于2008年12月22日正式关闭。
羊塔克库都克站是南疆铁路的一个车站，位于新疆维吾尔自治区阿克苏地区新和县、温宿县和拜城县交界，距吐鲁番站879公里，距喀什站558公里，现为乌鲁木齐铁路局阿克苏车务段所辖的五等中间站，是中国铁路系统内站名最长的车站，驻有羊塔克库都克电务工区，另驻有工务段。该站于2012年进行了扩建，新增道岔11组，拆除道岔4组；站改后股道增至4股，股道有效长度增至855米。
乌鲁木齐站，原称二宫站，为与原乌鲁木齐站区分，又称乌鲁木齐新客站，是位于中华人民共和国新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市沙依巴克区的一座火车站。原二宫站建立于1962年，为引入兰新高铁，于2012年10月开始在二宫站址建设新站。2016年7月1日开通试运营。为乌鲁木齐铁路局管辖的客货运特等站，是中国最西边的高铁车站，也是新疆规模最大、设施最先进的铁路交通枢纽。
南疆铁路是自兰新铁路上的新疆维吾尔自治区吐鲁番市至喀什地区的一条铁路线，全长1446.37公里，全线由乌鲁木齐铁路局管辖。有时喀和铁路也被视为南疆铁路的一部分。
乌鲁木齐南站，曾用名乌鲁木齐站，位于中华人民共和国新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市沙依巴克区南站路135号，于1962年启用，为乌鲁木齐铁路局管辖的客货运一等站，是乌鲁木齐市内的主要客运枢纽。经过铁路有兰新铁路、南疆铁路、北疆铁路和于2014年通车的兰新高铁。并有发往哈萨克斯坦阿拉木图和努尔苏丹的国际联运旅客列车。
焉耆站是南疆铁路的一个车站，位于新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州焉耆回族自治县焉耆镇，距吐鲁番站400公里，距喀什站1046公里，现为乌鲁木齐铁路局库尔勒车务段所辖的二等站，办理旅客乘降，行李、包裹托运及整车货物发到。
鱼儿沟站，位于中华人民共和国新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市达坂城区鱼儿沟镇，是南疆铁路上的火车站，1983年4月开通运营，由乌鲁木齐铁路局乌鲁木齐车务段管辖。
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