原子序数简称原子序，是一个原子核内质子的数量，因此也称质子数，也等于原子电中性时的核外电子数；拥有同一原子序的原子属于同一化学元素。原子序数的符号是 Z，通常原子序数标在元素符号的左下方，如：1H是氢，6C是碳。因为特定元素的原子序总是确定的，所以此值一般不需要标示。
类氢原子是只拥有一个电子的原子，与氢原子同为等电子体，例如，氦, 锂, 铍与硼等等都是类氢原子，又称为“类氢离子”。类氢原子只含有一个原子核与一个电子，是个简单的二体问题，系统内的作用力只跟二体之间的距离有关，是反平方定律连心力。这反平方连心力二体系统不需再加理想化，简单化。描述这系统的薛定谔方程式有解析解，也就是说，解答能以有限数量的常见函数来表达。满足这薛定谔方程式的波函数可以完全地描述电子的量子行为。在量子力学里，类氢原子问题是一个很简单，很实用，而又有解析解的问题。所推演出来的基本物理理论，又可以用简单的实验来核对。所以，类氢原子问题是个很重要的问题。
碳正离子，又称作碳阳离子，是一个带有正电的碳原子，其中最简单的形式为甲基碳正离子CH3，跟乙基碳阳离子C2H5。有些碳正离子基会带有两个或更多的正电，正电可能会在同一个或是不同的碳上，如乙烯双阳离子基C2H4。
X射线晶体学是一门利用X射线来研究晶体中原子排列的学科。更准确地说，利用电子对X射线的绕射作用，X射线晶体学可以获得晶体中电子密度的分布情况，再从中分析获得关于原子位置和化学键的资讯，即晶体结构。
化学元素常简称元素，是自然界中一百多种基本的金属和非金属元素纯物质，也是构成物质的基本单位，不能直接用化学反应分解。同一种化学元素是由相同的原子组成，也就是其原子中的原子核具有同样数量的质子，用一般的化学方法不能使之分解，并且能构成一切物质。一些常见元素的例子有氢、碳、氮、氧、硅、铁、硫、钙和钠等。
分子是一种构成物质的粒子，呈电中性、由单个或多个原子组成，原子之间因化学键而键结。能够单独存在、保持物质的化学性质；由分子组成的物质叫分子化合物。
次原子粒子，或称。是指比原子还小的粒子。例如：电子、中子、质子、介子、夸克、胶子、光子、玻色子、重力子。
电离能，或称、，常简记为EI，指的是将一个电子自一个孤立的原子、离子或分子移至无限远处所需的能量。更广义的用法，第一电离能定义为气态原子失去一个电子成为一价气态正离子所需的最低能量，记作I1；气态一价正离子失去一个电子成为气态二价正离子所需的能量称为第二电离能，记作I2。依此类推。
核裂变，在，是指由较重的原子，主要是指铀或钚，分裂成较轻的原子的一种核反应或放射性衰变形式。核裂变是由莉泽·迈特纳、奥托·哈恩、弗里茨·施特拉斯曼及奥托·罗伯特·弗里施等科学家在1938年发现。原子弹以及核电站的能量来源都是核裂变。早期原子弹应用钚-239为原料制成。而铀-235裂变在核电厂最常见。
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