大小和卓之乱，是乾隆二十二年中国回部白山派首领波罗尼都、霍集占兄弟发动的叛乱，清代文献称之为平定回部。两人出自中亚费尔干纳地区伊斯兰教苏菲派的分支白山派和卓家族，故人称波罗尼都为“大和卓”，霍集为“小和卓”。乾隆二十年清廷发兵准噶尔之役后，将被准噶尔囚禁的大小和卓兄弟释放，派波罗尼都随军招抚西域天山南路各地。不久定边左副将军阿睦尔撒纳反叛，大小和卓乘机控制了今新疆西南部一带。乾隆二十二年，霍集杀死副都统阿敏道，公然举兵自立。次年，乾隆皇帝发兵征讨大小和卓，清军在库车、叶尔羌、和阗等地与大小和卓交战。乾隆二十四年，大小和卓西逃，经葱岭进入巴达克山境内。霍集受伤身亡，波罗尼都被巴达克山首领素勒坦沙擒杀，战事结束。平定大小和卓之乱是乾隆皇帝的十全武功之一，自此天山南路重新纳入中国版图。
张格尔之乱是指从1820年开始至1828年止由白山派和卓张格尔率众在南疆发动的叛乱。叛乱延续八年之久，喀什市、英吉沙尔直隶厅、莎车县、和阗等城被攻陷。整个过程中浩罕汗国出动军队逾万人支持张格尔。
马黑麻，叶尔羌汗国第四任君主，拉失德的第五个儿子。阿不都哈林灭掉东察合台汗国之后，其兄阿不都哈林封他为吐鲁番的总督。《明史·西域传》把他当做了沙汗的弟弟。阿不都哈林在1592年死后，他即位为汗，击败乌兹别克汗国的入侵。他信奉纳克什班底教黑山派，黑山派的伊斯哈克、沙迪和卓父子在他晚年掌握国政。1610年，马黑麻去世，他的长子阿黑麻即位。
秃忽鲁帖木儿汗，教名艾布伯克里·穆罕默德，1347年在位。东察合台汗国第1代可汗。察合台后裔，父亲是笃哇幼子埃米尔火者。他是首一位公开宣布接受伊斯兰教的蒙兀儿斯坦可汗，他是由杜格拉特部从瓦刺找来阿克苏即位的。他在当可汗前，遇到和卓札马鲁丁受他感召，答复他即可汗位后信教。
玉素普，全名迈玛特玉素普，清代新疆回部白山派和卓后裔。曾于道光年间随浩罕汗国入侵新疆西部。
额敏和卓，中国回部吐鲁番鲁克沁人，清代第一代吐鲁番札萨克，封吐鲁番回部札萨克多罗郡王。额敏和卓因平定大小和卓之乱军功而图形紫光阁，是乾隆皇帝最为倚重的维吾尔族大臣。额敏和卓名字中的“和卓”是人名的一部分，并不是中亚宗教领袖玛哈图木·阿杂木后裔之称号“和卓”。
伊达雅图勒拉，尊号为“阿巴和加”，一译阿巴克霍加、阿巴霍加、阿帕克和卓，是明清之际叶尔羌汗国喀什噶尔地区白山派和卓家族的首领。
阿布杜·拉提甫，叶尔羌汗国阿黑麻汗的儿子，为喀什噶尔总督。阿黑麻汗在1619年打猎的时候，被维吾尔埃米尔杀害。埃米尔们在叶尔羌拥立他堂弟忽来失速檀为新的君主。阿布杜拉提甫在喀什噶尔为汗，进军叶尔羌，叛军被击溃，杀死忽来失速檀。黑山派沙迪和卓完全控制了汗国。他在位12年，26岁去世，埃米尔们拥立他的侄子阿克苏总督速檀阿黑麻为汗。
准格尔，是清代新疆白山派和卓波罗尼都之孙、萨木萨克次子。出生于浩罕汗国。“准格尔”是波斯语，意为“世界的征服者”。
伊思玛业勒，叶尔羌汗国第12任可汗，阿都剌因第四子，阿不都拉哈汗的弟弟，最初为阿克苏伯克。1667年，他信奉白山派的侄子尧勒瓦斯成了叶尔羌可汗，大肆镇压黑山派。黑山派势力流亡阿克苏，拥立伊思玛业勒为汗，西征叶尔羌。因为准噶尔部的支持，尧勒瓦斯暂时取得了胜利。但随后准噶尔浑台吉僧格在1668年，派人杀死尧勒瓦斯，白山派和卓拥立尧勒瓦斯的儿子阿不都·拉提夫即位。黑山派支持的伊思玛业勒乘机拿下叶尔羌，白山派和卓与阿不都·拉提夫逃到喀什噶尔。1670年4月2日，伊思玛业勒进入叶尔羌，派人杀害了阿不都·拉提夫和他的所有兄弟。大力扶植黑山派，大肆镇压白山派。白山派和卓远走西藏联合第五世达赖喇嘛。达赖指示自己的弟子噶尔丹帮助白山派。噶尔丹在1678年，征服了哈密、吐鲁番和焉耆，1680年，直取叶尔羌，伊思玛业勒被俘，送往伊犁监禁，噶尔丹改立阿卜都里什特为叶尔羌可汗。至此。叶尔羌汗国成为附属于准噶尔部的傀儡政权。
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