西溪湿地北站是杭州地铁在建中的杭州机场轨道快线与规划中的14号线的一座换乘车站，位于西湖区蒋村街道蒋墩路与文二西路交叉口。机场快线车站斜穿现状蒋墩路东侧地块，呈北偏西方向展布；14号线车站沿蒋墩路南北向布置。
火车东站站位于杭州市上城区杭州东站，是杭州地铁1号线、杭州地铁4号线、杭州地铁6号线和建设中的杭州机场轨道快线的一个换乘站点。
创景路站是杭州地铁5号线的一座站点，同时也是5号线一期的起点站，位于余杭区中央公园旁，于2015年开工，并与2020年4月23日投入使用。本站也是兴建中的杭州机场轨道快线与杭州地铁5号线的换乘车站。
平澜路站，工程名为钱江二路站，是杭州地铁在建中的杭州机场轨道快线的一座车站，位于萧山区宁围街道空港高架路与平澜路交叉口，车站呈东西向布置。
御道站是杭州地铁9号线与杭州机场轨道快线的一个车站，位于杭州市上城区彭埠街道御道社区。该站位于杭海路和御道路的交叉口，9号线为地下二层梯形岛式站台，机场快线为高架侧式站台。“御道”一名来源于清乾隆帝南巡时经位于该地的一条小路去钱塘江边的传说，9号线车站于2022年4月1日开通。
萧山国际机场站是杭州地铁1号线、杭州地铁7号线和杭州机场轨道快线的一个换乘站，位于杭州萧山国际机场T3航站楼前停车场内，呈东西向布置，其中1号线和7号线于2020年12月30日开通运营。
耕文路站，工程名为萧山高教园站，是杭州地铁在建中的杭州机场轨道快线的一座车站，位于萧山区宁围街道空港高架路与耕文路交叉口，车站呈东西向布置。
知行路站，工程名为萧山科技城站，是杭州地铁在建中的杭州机场轨道快线的一座车站，位于萧山区宁围街道空港高架路与知行路路交叉口，车站呈东西向布置，预留远期线路换乘条件。
海创园站是杭州地铁在建中的杭州机场轨道快线与规划中的杭州地铁12号线的一座换乘车站，位于余杭区五常街道文一西路与高教路交叉口处，机场快线车站沿文一西路布置，12号线车站沿高教路布置。
苕溪站是杭州地铁在建中的杭州机场轨道快线起点站、与杭州地铁车辆基地的接轨站，位于余杭区仓前街道现状龙大线与鲁凌线交叉口，车站呈南北向布置。
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