温泉红藻是一群生活在高温高酸环境中的单细胞红藻，主要分布于世界各地火山活动仍然活跃，并具有硫酸成分高之温泉水体之地区，如美国黄石国家公园、意大利火山区、新西兰火山区、印尼火山区及日本火山区。根据目前的分类系统，温泉红藻目前主要有三属六种。其中，Cyanidioschyzon merolae之细胞核基因组已被解密，也是目前唯一一种真核生物之基因组达到100%的解密。另外，其粒线体及叶绿体之基因组也完成解密。因此，对于温泉红藻的研究中，Cyanidioschyzon merolae可说是最佳的模式物种。部分藻种能栖息在硫磺口喷气处潮湿之土壤表层，另有些藻种能够存活于具有地热酸性潮湿之岩石表面下，靠着穿透石缝微弱之光线进行光合作用。
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