纤毛虫是纤毛虫门生物的通称，是一类较复杂的原生动物，主要特点是以纤毛作为运动器，细胞核一般分化出大核、小核、摄食胞器等，无性生殖为横二分裂，有性生殖为接合生殖，生活在淡水或海水中，也有寄生的。代表生物有草履虫，小瓜虫等。
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微孢子虫是一类可形成孢子的单细胞微生物，其形成的孢子大小为1至10微米，粒线体已退化成不含粒线体DNA的纺锤剩体，此类生物过去曾被认为是原生生物，后来分子研究显示其属于真菌，现被归为隐真菌门下的一个纲，属真菌界的基群。目前有超过200个属、约1500种微孢子虫被描述发表，绝大部分为感染动物的寄生，但也有感染纤毛虫、簇虫与马尔太虫等其他真核生物的案例被发现，其中有些物种为重寄生物，其宿主本身也寄生于其他动物中。微孢子虫皆在宿主细胞内复制生长，在宿主体外仅能以孢子的形式存在，大多专一地感染特定种类或类群的动物，其中许多为感染昆虫、甲壳类、鱼类与鸟类，也有物种可感染哺乳类，有约15种微孢子虫可在人类引起机会性感染，造成微孢子虫病。
四膜虫醇是一种五环三萜醇，最早发现于海洋纤毛虫四膜虫的细胞膜中，之后在其它纤毛虫、真菌、蕨类、细菌中都有发现。经过数百万年的成岩作用，海洋沉积物中的四膜虫醇会转化为对应的饱和烃类伽马蜡烷，可用于分析古代的海洋环境。
似明亮咽管虫是一种纤毛虫。2015年6月，华东师范大学生命科学学院原生动物实验室在华东师范大学闵行校区尚义湖内发现了这种纤毛虫，经分析，2017年将其命名为Naxella paralucida，研究成果发表于Journal of Medical Microbiology上。正模标本存放于华东师范大学生物历史博物馆中，副模标本存放于英国自然历史博物馆中。
车轮虫属是纤毛虫类原生生物车轮虫科下的一属，常寄生或偏利共生于水生生物，特别是鱼类。
上海游仆虫，是一种中等大小的纤毛虫，属旋毛纲少毛亚纲。长80-120微米，宽50-80微米，有54-58个微膜。1998年，宋微波院士于华东师范大学中山北路校区的池塘内发现了这一新物种，并命名为上海游仆虫。
游泳目是生物分类学之下的一个纤毛虫的目，属于寡膜纲缘毛亚纲，可栖息于海水或淡水中。其物种营寄生或共生策略，合共超过280个物种。游泳目物种与广泛范围的水生物种寄生或共生。这些物种包括有：鱼、两栖动物、软体动物、刺胞动物门、扁形动物门，以至其他纤毛虫，利用其反口盘连结至其宿主。Some mobilid species are 病原体s of wild or farmed fish, causing severe and economically damaging diseases such as 车轮虫属.
四膜虫是自由游离生活的纤毛虫原生动物，也可以从偏利共生转变为病原体生存模式。 它们在淡水池中很常见。在生物医学研究中用作模式生物的四膜虫属是嗜热栖热菌和热厌氧杆菌。
林奇科是叶咽纲齿管目之下一个纤毛虫的科，由Jankowski于1968年描述。
砂壳纤毛虫，又名有钟纤毛虫或丁丁虫，泛指隶属于纤毛虫旋毛纲之下丁丁虫亚目的物种。丁丁虫亚目旧属旋毛纲，现时被重新分类，成为了寡毛纲Choreotrichida目之下的五个亚目之一。本分类单元包括有种数在1000种左右，大多数在海洋中营浮游生活，属浮游动物，主要摄食浮游硅藻和鞭毛虫，是水体微食物环的重要组成部分，在水体中的能量流动和物质循环中占重要地位。
安·毕肖普，英国生物学家，剑桥大学格顿学院和皇家学会成员，也是皇家学会中少数女性成员之一。安·毕肖普出生于曼彻斯特，但职业生涯多半是在剑桥度过的。研究方向包括寄生虫学和原生生物。早年专注于研究纤毛虫寄生虫，其中一种导致了家养火鸡的黑死病，这一阶段的成果也为她后期的研究奠定了基础。博士时期，她投身寄生类变形虫研究，并尝试用化学疗法治疗阿米巴痢疾等变形虫疾病。
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