脱镁叶绿素与光合作用中光反应的电子传递链有关。叶绿素在经过加酸或加热或脱镁作用后会变成脱镁叶绿素,颜色也会改变。在水污染的地方,会造成浮游植物细胞破碎死亡时,其原本所含的叶绿素也跟着被破坏,而转变成脱镁叶绿素。因此脱镁叶绿素的含量比例可以作为水质的指标之一。
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P680或光系统 II主要供体是指两种特殊叶绿素二聚体中的任一种,PD1或PD2。 这两个特殊对形成一个激子二聚体,这意味着它们在单个实体中起作用;也就是说,它们就像是一个单一的分子一样在激发态 。数字680是其在电磁波谱吸收光谱学最大值的红色部分 。主要供体通过吸收合适频率的光子或通过光系统 II内其他叶绿素的激发能量转移来接收激发能量。在激发期间,电子被激发到更高的能级。 该电子随后被初级电子受体捕获,该初级电子受体是位于P680附近的光系统II内的脱镁叶绿素分子。 随后通过源自水的电子还原氧化的P680。