马格丽塔岛是哥伦比亚的岛屿，位于该国北部马格达莱纳河，由玻利瓦省负责管辖，面积2,220平方公里，是该国最大的河岛，最高点海拔高度16米。
瓜查罗斯洞国家自然公园，是哥伦比亚最古老的国家公园，位于该国南部乌伊拉省和卡克塔省的安地斯山脉地区，成立于1960年11月9日，面积9,000公顷平方公里，处于马格达莱纳河和雅普拉河流域的喀斯特地形。
考卡河是哥伦比亚西部的河流，全长1,349公里，集水区面积约63,300平方公里，最终在圣克鲁斯德蒙波斯以南注入马格达莱纳河。
马格达莱纳侧颈龟是南美侧颈龟科的一种龟。生活在哥伦比亚北部的马格达莱纳河流域及委内瑞拉马拉开波湖南部。
巴兰卡韦梅哈是哥伦比亚的城市，位于该国东北部马格达莱纳河畔，由桑坦德省负责管辖，距离首府布卡拉曼加110公里，始建于1536年，面积1,154平方公里，海拔高度75米，2010年人口约300,000。
巴兰基亚是位于哥伦比亚北部加勒比海畔的马格达莱纳河三角洲的一座城市，也是大西洋省的首府，人口约170万。
等齿视星鲶为辐鳍鱼纲鲶形目视星鲶科的其中一种，为热带淡水鱼，分布于南美洲马格达莱纳河流域，体长可达8公分，栖息在底层水域，生活习性不明。
马格达河鲮脂鲤为辐鳍鱼纲脂鲤目脂鲤亚目鲮脂鲤科的其中一个种，分布于南美洲哥伦比亚Atrato、Sinu与Cauca-马格达莱纳河流域，体长可达30公分，栖息在河川底中层水域，生活习性不明。
波哥大河是哥伦比亚的河流，位于该国中部，由昆迪纳马卡省负责管辖，属于马格达莱纳河的一部分，河道全长375公里，集水区面积5,996平方公里。
托利马省是哥伦比亚中西部的一个省，中科特勒拉山脉斜贯，东界马格达莱纳河。面积为23,562平方公里，2018年人口为1,419,957人。首府伊瓦格。
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