孔垄站位于湖北省黄梅县孔垄镇，是京九铁路和合九铁路的一座火车站，等级为四等站。该站由南昌铁路局九江车务段管辖，是一个局界站：西北京九铁路上行方向为武汉铁路局管辖路段；东北合九铁路上行方向为上海铁路局路段。该站距北京西站1287公里，距常平站1028公里，本站及相邻京九铁路上下行区间均为电气化区段，合九铁路为非电气化区段。车站建于1996年，现办理客运、货运业务。
九江站位于中华人民共和国江西省九江市濂溪区长虹大道60号，为客运一等站，途经线路有京九铁路、京港高速铁路、武九铁路、武九客运专线、衢九铁路和昌九城际铁路、合九铁路、铜九铁路。该站是京九铁路进入江西省境内后的第一站，于1996年随京九铁路工程一同启用，目前由南昌铁路局九江车务段管辖。
合肥站位于中华人民共和国安徽省合肥市瑶海区胜利路北端与站前路交口，于1997年启用，为上海铁路局管辖的客货运一等站。经过铁路有合宁铁路、合武铁路、宁西铁路、淮南铁路、合蚌客运专线、郑合铁路、商杭客运专线合九铁路。目前日均办理旅客列车220多列，包括20多列始发旅客列车。
蜀山东站原名合肥西站，站址位于中国安徽省合肥市蜀山区望江路与翡翠路交叉口以南翡翠路上，始建于1995年。离合肥站19公里，是合九铁路的首站。合肥西站列车主要以安庆、九江、南昌方向为主，兼有广州、北京方向的过路列车停靠。该站于2010年7月竹溪站建成后不再办理货运业务，2013年开始进行了全封闭大修，车站也进行了整体南移，原计划随合福客运专线通车而恢复运营。后因上海铁路局认为既有合肥站和合肥南站运能充足、加停合肥西站反而会降低线路运行效率而缓开客运至今。2020年11月20日起，车站名称由合肥西站变更为蜀山东站。
合肥站位于中华人民共和国安徽省合肥市瑶海区胜利路北端与站前路交口，于1997年启用，为上海铁路局管辖的客货运一等站。经过铁路有合宁铁路、合武铁路、宁西铁路、淮南铁路、合蚌客运专线、郑合铁路、商杭客运专线合九铁路。目前日均办理旅客列车220多列，包括20多列始发旅客列车。
合肥东站，位于中国安徽省合肥市瑶海区，位于淮南线、宁西铁路上，为三级五场混合式编组站，1996年启用下行场，编组场则于1998年启用。车站承担华东第二货运通道各类货运列车和合肥枢纽运输小运转列车，担负阜阳、蚌埠、芜湖、信阳、合九铁路、合肥枢纽等6个方向的车辆解编作业。
合肥站位于中华人民共和国安徽省合肥市瑶海区胜利路北端与站前路交口，于1997年启用，为上海铁路局管辖的客货运一等站。经过铁路有合宁铁路、合武铁路、宁西铁路、淮南铁路、合蚌客运专线、郑合铁路、商杭客运专线合九铁路。目前日均办理旅客列车220多列，包括20多列始发旅客列车。
太湖站位于中华人民共和国安徽省安庆市太湖县晋熙镇，是合九铁路上的火车站，建于1995年，由上海铁路局管辖，办理客货运业务，吸引区为太湖县、望江县及宿松县等地区。
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