羰基氰化物间氯苯腙是一种氧化磷酸化抑制剂。它是一种离子载体。一般来说，CCCP导致细胞的逐渐损害以及生命体的死亡。 它主要影响线粒体中的蛋白质合成。 CCCP的作用机理是使电子载体在电子传递链的正常活动下形成的质子浓度梯度解偶联蛋白。这种化学物质实质上以离子载体形式减少了ATP合酶以最佳方式运行的能力。
NADH脱氢酶是一种位于线粒体内膜催化电子从NADH传递给辅酶Q的酶。此酶是线粒体中氧化磷酸化的“入口酶”。
是一种存在于大多数真核细胞中的由两层膜包被的细胞器，直径在0.5到10微米左右。除了溶组织内阿米巴、蓝氏贾第鞭毛虫以及几种微孢子虫外，大多数真核细胞或多或少都拥有线粒体，但它们各自拥有的线粒体在大小、数量及外观等方面上都有所不同。这种细胞器拥有自身的遗传物质和遗传体系，但因其基因组大小有限，所以线粒体是一种半自主胞器。线粒体是细胞内氧化磷酸化和合成三磷酸腺苷的主要场所，为细胞的活动提供了化学化学能，所以有“细胞的发电站”之称。除了为细胞供能外，线粒体还参与诸如细胞分化、细胞信息传递和细胞凋亡等过程，并拥有调控细胞生长和细胞周期的能力。
2,4-二硝基苯酚，分子式C6H4N2O5，是一种细胞代谢毒素。DNP能够通过运送质子通过线粒体膜使氧化磷酸化解偶联蛋白，使得能量被大量消耗却不被用来制造三磷酸腺苷。
梅毒密螺旋体，常称为梅毒螺旋体，是一种螺旋体门下的细菌，具有多个亚种，可引起梅毒。它仅在人类之间传播。它是一种螺旋状的微生物，通常有6-15微米长，0.1–0.2微米宽。梅毒密螺旋体缺乏三羧酸循环或氧化磷酸化，导致其代谢活动最小化。密螺旋体具有细胞质和细胞膜。普通的光学显微镜看不见它，只有使用特别的暗场显微镜才能看到。梅毒螺旋体由三个亚种组成，每一种都能引起不同的疾病。
电子传递链又称呼吸链，是氧化磷酸化的一部分，位于原核生物细胞膜或者真核生物的粒线体内膜上，叶绿体在类囊体膜上进行光合磷酸化过程，高能电子在膜上一系列蛋白传送的过程，借由膜蛋白的氧化与还原将其能量逐渐释放出来，造成膜外与膜内质子浓度的差异，而这些质子再由高浓度往低浓度运送，伴随着电子转移穿膜，其中产生的电化学质子浓度的差异驱动三磷酸腺苷合成。电子在电子传递链中的最终受体是氧分子。
苹果酸-天冬氨酸穿梭是真核细胞中一个转运在糖酵解过程中传出的电子跨越半透膜的线粒体内膜以进行氧化磷酸化的生物化学体系。这些电子以还原性等效物的形式进入线粒体的电子传递链中以生成三磷酸腺苷。正因为线粒体内膜对于电子传递链的第一还原还原性等效物即还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸是不通透的，穿梭体系才有存在的必要。电子为了绕行，苹果酸携带着还原性等效物跨越线粒体膜。
是一种存在于大多数真核细胞中的由两层膜包被的细胞器，直径在0.5到10微米左右。除了溶组织内阿米巴、蓝氏贾第鞭毛虫以及几种微孢子虫外，大多数真核细胞或多或少都拥有线粒体，但它们各自拥有的线粒体在大小、数量及外观等方面上都有所不同。这种细胞器拥有自身的遗传物质和遗传体系，但因其基因组大小有限，所以线粒体是一种半自主胞器。线粒体是细胞内氧化磷酸化和合成三磷酸腺苷的主要场所，为细胞的活动提供了化学化学能，所以有“细胞的发电站”之称。除了为细胞供能外，线粒体还参与诸如细胞分化、细胞信息传递和细胞凋亡等过程，并拥有调控细胞生长和细胞周期的能力。
铁硫蛋白是一类蛋白质，其特征是其中存在着铁-硫簇，铁-硫簇中含有与硫连接着的二、三或四个铁中心，并可处于各种变化的氧化态上。铁-硫簇存在于多种金属蛋白之中，例如铁氧还蛋白、氢化酶、Coenzyme Q - cytochrome c reductase、琥珀酸脱氢酶，和固氮酶等。铁硫蛋白是粒线体中执行氧化磷酸化过程的重要成员，像电子传递链中的第一蛋白复合体及第二蛋白复合体都含有铁硫簇。此外，像是顺乌头酸酶和S-adenosylmethionine依赖蛋白中也有铁硫簇，另外硫辛酸及生物素的合成也牵涉到铁硫簇。可见铁硫簇的作用范围包括呼吸作用、光合作用、羟化作用以及细菌的氢和氮的固定。
电子传递链又称呼吸链，是氧化磷酸化的一部分，位于原核生物细胞膜或者真核生物的粒线体内膜上，叶绿体在类囊体膜上进行光合磷酸化过程，高能电子在膜上一系列蛋白传送的过程，借由膜蛋白的氧化与还原将其能量逐渐释放出来，造成膜外与膜内质子浓度的差异，而这些质子再由高浓度往低浓度运送，伴随着电子转移穿膜，其中产生的电化学质子浓度的差异驱动三磷酸腺苷合成。电子在电子传递链中的最终受体是氧分子。
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