子囊菌门是真菌界中种类最多的一个门。顾名思义，本门成员的共同特征是在有性生殖相产生的后代孢子有一个保护囊，即子囊，这很像哺乳类胎儿都有一个羊膜囊保护一样。无论是酵母亚门的单细胞有性生殖，还是其余种属的多细胞有性生殖，无有例外。但保护孢子的子囊可以是永久的，也可以是稍纵即逝的，以致在标本准备过程中往往消失而很难看见。子囊菌门成员通常被称为囊菌或子囊菌，是真菌界最大的门，超过64,000种 ，与担子菌门一起构成了双核亚界。
伞菌亚门是真菌界担子菌门的3个分类之一，包括许曾被归类于多系群帽菌纲的物种。伞菌亚门包含20,000个物种，而且其中大约98%是属于伞菌纲：大多数真菌是熟知的蕈类，包含篮子菌和马勃菌。伞菌亚门里的物种中，不是伞菌纲的包含了白木耳、一些“酵母菌”、木耳等；这些物种被集合在银耳纲或是花耳纲当中。
子囊菌门是真菌界中种类最多的一个门。顾名思义，本门成员的共同特征是在有性生殖相产生的后代孢子有一个保护囊，即子囊，这很像哺乳类胎儿都有一个羊膜囊保护一样。无论是酵母亚门的单细胞有性生殖，还是其余种属的多细胞有性生殖，无有例外。但保护孢子的子囊可以是永久的，也可以是稍纵即逝的，以致在标本准备过程中往往消失而很难看见。子囊菌门成员通常被称为囊菌或子囊菌，是真菌界最大的门，超过64,000种 ，与担子菌门一起构成了双核亚界。
酵母是真核生物真菌界之下的一个非分类学术语，泛指能发酵糖类的各种单细胞微生物，有人认为它们不是真菌而是原生生物。不同的酵母菌在进化和分类地位上有异源性；而酵母菌种类很多，已知的约有56属500多种。一些酵母菌能够通过出芽生殖的方式进行无性生殖，也可以通过形成孢子的形式进行有性生殖。酵母经常被用于酒精酿造或者面包烘焙行业。目前已知有1500多种酵母，大部分被分类到子囊菌门。酵母菌属兼性厌氧菌。
线虫草科是真菌界子囊菌门粪壳菌纲肉座菌目下的一个科。共6个属：
线虫草科是真菌界子囊菌门粪壳菌纲肉座菌目下的一个科。共6个属：
线虫草科是真菌界子囊菌门粪壳菌纲肉座菌目下的一个科。共6个属：
瘤菌根菌属为真菌界担子菌门伞菌纲鸡油菌目胶膜菌科的一个属。瘤菌根菌属真菌与一些植物共生。例如一些兰花是真菌异养的植物，在自然条件下，只有合适的共生真菌侵染种子，为其提供碳素和无机营养，粉尘状的兰花种子才能成功萌发。而且，兰花幼苗的发育，成年兰花的生长和繁殖都需要菌根真菌的共生。
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