FTO基因 编辑
FTO基因全称脂肪和肥胖相关基因,在人类基因组中位于16号染色体,此基因编码的FTO蛋白属AlkB家族,为α-酮戊二酸依赖性羟化酶。此基因可能与肥胖症有关。2011年何川实验室发现FTO蛋白可将MRNA上的N6-甲基腺苷去甲基化成腺苷,为第一个被发现的mRNA去甲基酶。
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N-甲基腺苷是真核生物细胞MRNA中最常见的修饰,也见于TRNA、核糖体RNA、SnRNA和LncRNA等其他种RNA,细胞RNA中约有0.1%至0.4%的腺苷位点具有此修饰。m6A最早在1970年代即被发现,但未知其功能,近年随着其修饰酶、去修饰酶和识别蛋白的发现,其修饰机制与功能逐渐明朗。m6A是由一甲基转移酶复合体修饰,复合体包括METTL3、METTL14、WTAP、RBM15、KIAA1429与METTL5等,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到RNA的腺苷上;FTO基因蛋白与ALKBH5则为m6A去甲基酶,可移除RNA上m6A的甲基;具YTH结构域的蛋白、IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、FMR1和RBMX等蛋白可与mRNA上的m6A结合,为其识别蛋白,因蛋白种类和RNA序列而异可促进或抑制其转译、降解、RNA剪接等。研究m6A转录组的技术包括m6A测序、mRNA甲基化测序、m6A-CLIP与SCARLET等。有数种癌症与m6A修饰的异常有关。除真核生物外,许多RNA病毒也具有m6A修饰,可能与其感染、复制有关。
N-甲基腺苷是真核生物细胞MRNA中最常见的修饰,也见于TRNA、核糖体RNA、SnRNA和LncRNA等其他种RNA,细胞RNA中约有0.1%至0.4%的腺苷位点具有此修饰。m6A最早在1970年代即被发现,但未知其功能,近年随着其修饰酶、去修饰酶和识别蛋白的发现,其修饰机制与功能逐渐明朗。m6A是由一甲基转移酶复合体修饰,复合体包括METTL3、METTL14、WTAP、RBM15、KIAA1429与METTL5等,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到RNA的腺苷上;FTO基因蛋白与ALKBH5则为m6A去甲基酶,可移除RNA上m6A的甲基;具YTH结构域的蛋白、IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、FMR1和RBMX等蛋白可与mRNA上的m6A结合,为其识别蛋白,因蛋白种类和RNA序列而异可促进或抑制其转译、降解、RNA剪接等。研究m6A转录组的技术包括m6A测序、mRNA甲基化测序、m6A-CLIP与SCARLET等。有数种癌症与m6A修饰的异常有关。除真核生物外,许多RNA病毒也具有m6A修饰,可能与其感染、复制有关。
N-甲基腺苷是真核生物细胞MRNA中最常见的修饰,也见于TRNA、核糖体RNA、SnRNA和LncRNA等其他种RNA,细胞RNA中约有0.1%至0.4%的腺苷位点具有此修饰。m6A最早在1970年代即被发现,但未知其功能,近年随着其修饰酶、去修饰酶和识别蛋白的发现,其修饰机制与功能逐渐明朗。m6A是由一甲基转移酶复合体修饰,复合体包括METTL3、METTL14、WTAP、RBM15、KIAA1429与METTL5等,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到RNA的腺苷上;FTO基因蛋白与ALKBH5则为m6A去甲基酶,可移除RNA上m6A的甲基;具YTH结构域的蛋白、IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、FMR1和RBMX等蛋白可与mRNA上的m6A结合,为其识别蛋白,因蛋白种类和RNA序列而异可促进或抑制其转译、降解、RNA剪接等。研究m6A转录组的技术包括m6A测序、mRNA甲基化测序、m6A-CLIP与SCARLET等。有数种癌症与m6A修饰的异常有关。除真核生物外,许多RNA病毒也具有m6A修饰,可能与其感染、复制有关。