转运核糖核酸,又称传送核糖核酸、转移核糖核酸,通常简称为tRNA,是一种由76-90个核苷酸所组成的RNA,其3'端可以在氨酰-tRNA合成酶催化之下,接附特定种类的氨基酸。转译的过程中,tRNA可借由自身的反密码子识别MRNA上的密码子,将该密码子对应的氨基酸转运至核糖体合成中的多肽上。每个tRNA分子理论上只能与一种氨基酸接附,但是遗传密码有简并性,使得有多于一个以上的tRNA可以跟一种氨基酸接附。
小分子核糖核酸,又称微RNA,是真核生物中广泛存在的一种长约21到23个核苷酸的RNA分子,可调节其他基因的表达。miRNA来自一些从DNA转录而来,但无法进一步转译成蛋白质的RNA。miRNA通过与目标MRNA结合,进而抑制转录后的基因表达,在调控基因表达、细胞周期、生物体发育时序等方面起重要作用。在动物中,一个miRNA通常可以调控数十个基因。
翻译,是蛋白质生物合成过程中的第一步。翻译是根据遗传密码的中心法则,将成熟的MRNA分子中“碱基的排列顺序”解码,并生成对应的特定氨基酸序列的过程。但也有许多转录生成的RNA,如TRNA、RRNA和小核RNA等并不被翻译为氨基酸序列。
反式作用干扰小RNA是陆生植物的一类小干扰RNA,可进行RNA干扰,抑制其他基因的基因表现。tasiRNA最早于2004年在模式生物阿拉伯芥中发现,植物有TAS1、TAS2、TAS3与TAS4四个基因家族的基因编码tasiRNA,这些基因转录产生的RNA后会被多腺苷酸化,在MiRNA介导之下TAS1、TAS2与TAS4转录的RNA5'端会被Ago1切割,TAS3转录的RNA则是3'端被Ago7切割,接着此RNA由RNA复制酶RDR6转为双股RNA后,再被DCL4切割成长21核碱基且3'端有突出端的小双股RNA,可与RNA诱导沉默复合体结合以进行RNA干扰,将目标MRNA的切割移除。
EF-Tu是原核延伸因子之一。延伸因子在核糖体翻译蛋白质中有重要作用。t-RNA通过反密码子与MRNA识别,携带在TRNA上的单个氨基酸连接到新生成的肽链上,完成一次肽基转移反应后,下一个氨酰tRNA进入核糖体中的位置继续合成。
YTHDF2是一个位于人类第1号染色体上的基因,编码一种属于YTH蛋白质超家族下的蛋白YTHDF1。YTHDF1基因编码的YTHDF1蛋白能够识别并结合N6-甲基腺苷转录后修饰的MRNA,并增加与之结合的mRNA易位效率。YTHDF2蛋白除含有YTH结构域外,还含有一个可能与信号转导相关的高脯氨酸区。
蛋白质折叠是蛋白质获得其功能性结构和构象的物理过程。通过这一物理过程,蛋白质从无规则卷曲折叠成特定的功能性三维结构。在从MRNA序列翻译成线性的氨基酸链时,蛋白质都是以去折叠多肽或无规则卷曲的形式存在。
转运-信使RNA是细菌中一种同时具有MRNA与TRNA功能与结构的RNA,此RNA本身如mRNA般具有编码区,3'端可如tRNA般由丙胺酸-tRNA合成酶加上一个丙胺酸,长度多介于320至400核碱基之间,当细胞中的核糖体转译mRNA发生核糖体停滞时,tmRNA可与SmpB蛋白与EF-Tu等组合成一核糖核蛋白,并结合至核糖体空出的A位以启动反式转译,即将核糖体合成中的多肽转移至其3'端的丙胺酸上,以tmRNA的编码区为模板继续转译数个氨基酸后再遇到终止密码子而结束,转译出的蛋白末端带有丙胺酸和tmRNA编码的小段多肽序列,此段序列通常会被细胞中的蛋白酶识别而将整个蛋白质降解,造成转译停滞的mRNA也会被水解移除。
核糖体停滞是细胞中核糖体转译MRNA时发生停滞的现象,在原核生物与真核生物细胞中皆会发生。核糖体分析等实验技术可用于找出mRNA中发生核糖体停滞的位点。
遗传密码又称遗传编码,是遗传的传递规则,将DNA或MRNA序列以三个核苷酸为一组的“密码子”转译为蛋白质的氨基酸序列,以用于蛋白质生物合成。几乎所有的生物都使用同样的遗传密码,称为“标准遗传密码”;即使是非细胞结构的病毒,它们也是使用标准遗传密码。有些具感染性的致病因子,使用一些稍微不同的遗传密码,如朊毒体以蛋白质为遗传密码。密码子简并性是遗传密码的突出特征。