日本货物铁道股份有限公司是日本国有铁道在1987年4月1日时民营化解散改组之后，继承原本日本国铁所属之铁路事业的7间JR公司之一。实务上经常简称为JR货物，但在该公司所拥有的列车车身以及货柜上也经常可以见到该公司的英语简称JR Freight或JRF，代表颜色为灰蓝色。该铁路公司在日本全国范围内均有业务。
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衣浦临海铁道株式会社 是在爱知县衣浦湾沿岸的衣浦港经营货物铁路的铁路公司。是由日本货物铁道、爱知县等沿线自治体，以及相关企业出资成立的日本第三部门铁道。
安治川口车站是一由西日本旅客铁道与日本货物铁道所共用的铁路车站，位于日本大阪府大阪市此花区岛屋6丁目。安治川口车站是JR西日本樱岛线的沿线车站，也是JR西日本旗下大阪近郊铁路路线群都市网络所属的车站，根据JR的特定都区市内制度，被划分为“大阪市内”的车站之一。
长津田车站是一个位于神奈川县横滨市绿区长津田四丁目，属于东日本旅客铁道、日本货物铁道、东急电铁、横滨高速铁道的铁路车站。
道南渔火铁道株式会社，简称道南渔火铁道，是一家日本北海道的日本第三部门铁道经营者，总部设于函馆市若松町、JR北海道函馆支社旁边。是因应JR北海道于2016年3月26日运营北海道新干线时，接收原位于道内江差线的线道、车站及周边设备而成立。公司当初的资本金全由道厅及沿线的自治政府出资，合共2亿4000万日圆，随后获日本货物铁道及北连农业协同组合连合会等注资，使资本金增至4亿6,600万日圆。
名古屋站是位于日本爱知县名古屋市中村区一个由东海旅客铁道、日本货物铁道、名古屋临海高速铁道、名古屋市交通局等单位所共用的铁路车站。名古屋站拥有全世界最高的车站大厦“JR中央大厦”，其白色双塔是名古屋站的重点特色。2000年入选中部车站百选。
胜田车站是一由东日本旅客铁道、日本货物铁道与地方第三部门铁路业者常陆那珂海滨铁道所共用的铁路车站，位于日本茨城县常陆那珂市武丰町，是JR东日本常磐线与常陆那珂滨海铁道凑线的交会车站。
鱼津站是隶属于爱之风富山铁道及日本货物铁道的铁路车站，座落于富山县鱼津市，是鱼津市的中心车站，亦是爱之风富山铁道及过往JR西日本在鱼津市的唯一车站，现时为快速列车停车站。过往由JR西日本管理时，亦是特急列车的停车站，过半数的“白鹰号列车”、全部的“北越”均在本站停靠；更有1来回的“雷鸟号列车”以此为总站。不过随北陆新干线通车及经营权转换，所有特急列车均被取消，只保留每天3来回的快速列车。
鱼津站是隶属于爱之风富山铁道及日本货物铁道的铁路车站，座落于富山县鱼津市，是鱼津市的中心车站，亦是爱之风富山铁道及过往JR西日本在鱼津市的唯一车站，现时为快速列车停车站。过往由JR西日本管理时，亦是特急列车的停车站，过半数的“白鹰号列车”、全部的“北越”均在本站停靠；更有1来回的“雷鸟号列车”以此为总站。不过随北陆新干线通车及经营权转换，所有特急列车均被取消，只保留每天3来回的快速列车。
梅田地区的铁道车站 位于日本大阪府大阪市北区梅田，包括JR西日本的大阪站、北新地站，大阪市高速电气轨道的梅田站、东梅田站、西梅田站、阪急电铁的大阪梅田站以及阪神电铁的大阪梅田站。而日本货物铁道的梅田车站已于2013年3月15日关闭。
下馆车站是一位于日本茨城县筑西市乙，由东日本旅客铁道、真冈铁道、关东铁道与日本货物铁道所共用的铁路车站。下馆车站是JR东日本所属的干线路线、水户线，真冈铁道唯一的一条路线、真冈线，与关东铁道所属的常总线之交会车站，也是常总线与真冈线的起讫端点。其中，靠近车站北口的站区主要由JR东日本所使用，而靠南口的部分则是关东铁道所有，至于真冈铁道，则只有在主要列车发车或到站时，才会在月台上配置站员。
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