蛋白质结构域是蛋白质中的一类结构单元,是构成蛋白质三级结构的基本单元。
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蛋白质结构是指蛋白质分子的空间结构。作为一类重要的生物大分子,蛋白质主要由碳、氢、氧、氮、硫等化学元素组成。所有蛋白质都是由20种不同的氨基酸连接形成的多聚体,在形成蛋白质后,这些氨基酸又被称为残基。蛋白质和多肽之间的界限并不是很清晰,有人基于发挥功能性作用的结构域所需的残基数认为,若残基数少于40,就称之为多肽或肽。要发挥生物学功能,蛋白质需要正确蛋白质折叠为一个特定构型,主要是大量的非共价键相互作用来实现;此外,在一些蛋白质蛋白质折叠中,二硫键也起到关键作用。为了从分子水平上了解蛋白质的作用机制,常常需要测定蛋白质的三维结构。由研究蛋白质结构而发展起来了结构生物学,采用了包括X射线晶体学、核磁共振以及冷冻电镜等技术来解析蛋白质结构。
鸟苷酸结合蛋白是一类可被干扰素-γ诱导的GTP酶蛋白质家族,是三种干扰素诱导GTP酶家族之一,另外两种分别是分子量约47kDa的免疫相关鸟苷三磷酸酶家族成员包括干扰素诱导GTP酶5和免疫相关GTP酶家族M蛋白;以及MX蛋白家族,成员包括MX1和MX2,在人类基因组中,总共有7个GBP基因,参与抗微生物和病毒病原体的免疫系统。在结构上,hGBP1包含两个结构域,一个致密球状的N-末端结构域,用于执行GTP酶功能,另一个是Α螺旋组成的手指状C-末端结构域。
SK-OV-3是一种染色体倍性卵巢癌细胞系,最初在1973年分离自一名64岁白人女性囊腺癌患者的腹水。在63.3%的SK-OV-3细胞中,染色体的模态数为43,而范围则为42至45。 SK-OV-3对许多用于鉴定上皮来源癌的抗原,呈阳性反应,包括波形蛋白、高分子量细胞角蛋白、低分子量细胞角蛋白、上皮膜抗原和蛋白酪氨酸磷酸酶C型受体。早期的研究报告指出,SK-OV-3细胞不会表达CA-125,而该抗原后来成为检测卵巢癌最常用的生物标志物,并且通过剂量反应曲线表明SK-OV-3细胞对铂敏感。随后的研究更显示,SK-OV-3细胞中CA-125 C末端结构域的异位表达,降低了其对顺铂诱导的细胞凋亡的敏感性。目前已经有研究指出其具有中度分化能力,将SK-OV-3注入裸鼠属后,裸鼠In vivo会产生大的实体赘生物,并且会松散地附着在骨盆区域、肠或大网膜的脂肪上。
SUN结构域是一种保守序列C-末端蛋白结构域,名称来自:Sad1p,UNC-84 的首字母缩写,长度不到100个氨基酸残基,常位于跨膜蛋白的附近,可与含有KASH结构域的蛋白质相互作用。
SH3结构域是最早在病毒信号转导接头蛋白v-Crk及酪氨酸激酶Src、Abl中发现的长约60个氨基酸残基的保守序列结构域,在磷酸肌醇3-激酶、Ras超家族G蛋白、cdc25中也存在
KASH结构域是一种保守序列C-末端蛋白结构域,名称来自:Klarsicht,ANC-1,Syne Homology 的首字母缩写,长度不到30个氨基酸残基,大部分含有此结构域的蛋白与核膜定位有关,可与含有SUN结构域的蛋白质相互作用。
ENTH结构域是一种涉及内吞作用和细胞骨架机制的蛋白质结构域。ENTH结构域长约150个氨基酸,在各物种中保守序列,最初发现于内吞适配蛋白的N-末端,因而得名。
METTL3全称为甲基转移酶样蛋白3,又称N6-腺苷甲基转移酶复合体催化亚基,在人类基因组中由14号染色体上的METTL3基因编码。此蛋白为N6-腺苷甲基转移酶复合体中具甲基转移酶活性的组成蛋白,由580个氨基酸组成,大小为70kDa,包含一锌指结构域与一甲基转移酶结构域,可将S-腺苷甲硫氨酸上的甲基转移到MRNA中的腺苷上,将其甲基化成N6-甲基腺苷。METTL3与另一蛋白METTL14共同组成N6-腺苷甲基转移酶复合体的核心,但METTL14在此复合体中仅有与RNA结合和稳定结构的功能,无催化甲基化的功能。METTL3的基因表现异常与多种癌症有关,许多案例中METTL3为致癌基因,在许多癌症中表现量增加。
PABPN1全名为多聚腺苷酸结合核蛋白1,在人类基因组中由14号染色体编码,是一种多聚腺苷酸结合蛋白。此蛋白位于细胞核中,其N端有一卷曲螺旋结构域,中间为RNA识别基序,C端则有核定位序列。在mRNA转录结束后即参与多腺苷酸化的反应,以N端与多聚腺苷酸聚合酶结合,并以RRM与刚生成的多腺苷酸尾结合以促进多腺苷酸化进行,且可抑制细胞在较靠近终止密码子的多腺苷酸化讯号以切割和聚腺苷酸特异性因子切割mRNA并加上多腺苷酸尾,促使其使用距离较远的多腺苷酸化讯号,因而形成较长的3'非转译区。
G蛋白是指鸟嘌呤核苷酸结合蛋白。它含有一个鸟苷酸结合结构域,由α、β、γ三个蛋白质亚基组成。激活状态下的G蛋白可以激活腺苷酸环化酶,产生第二信使CAMP,从而产生进一步的生物学效应。