强化子 编辑
又可译为,是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。强化子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,甚至不一定与基因位于同一染色体。这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
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强化子RNA是真核生物基因组中强化子序列转录产生的非编码RNA,长50核碱基至4000nt之间,此类RNA于2010年由RNA测序与ChIP-seq等大规模测序技术测得。强化子为基因组中与RNA聚合酶Ⅱ、中介体和转录因子结合以启动基因转录的重要序列,其转录生成的强化子RNA大多留在细胞核中,此类RNA大多不稳定,易被细胞核中的外切体降解,但可能可调控其他基因的转录。并非所有强化子皆可转录,有研究显示仅有少数强化子可转录产生出eRNA,可能为较为活跃的强化子。有些强化子RNA具复杂的次级结构,并带有M6A等碱基修饰。
转录前起始复合体是真核生物与古菌细胞基因转录前由约100个蛋白质组成的复合体,真核生物转录MRNA的前起始复合体包括负责转录的RNA聚合酶Ⅱ、6种通用转录因子与其他辅助蛋白,组成过程中TFIID的TATA结合蛋白次单元首先在TFIIA的帮助下与DNA启动子的TATA盒结合,接着TFIIB也会与启动子上的BRE元件结合,D、A、B三者与启动子结合组成的复合体可再吸引TFIIF和RNA聚合酶Ⅱ前来,随后TFIIE、TFIIH再先后与复合体结合,后者结合DNA中的模板股,具解旋酶活性,可将启动子区域的DNA双股螺旋解开以形成转录泡,此外还具激酶活性,可将RNA聚合酶Ⅱ的C端结构域磷酸化以活化聚合酶开始转录。除了以上六种通用转录因子外,转录前起始复合体还包括中介体、染色质重塑酶、其他共同活化物等调控蛋白,其中中介子与转录前起始复合体结合后,可与距离较远的调控序列强化子结合以促进转录进行。古菌的转录前起始复合体与真核生物的类似,但较为简化,仅需TATA结合蛋白、TFIIB与RNA聚合酶,且转录因子与DNA结合的方向和真核生物的可能为相反。
中介体旧称DRIP或TRAP,是真核生物细胞核中启动基因转录所需的蛋白质复合体,于1990年由美国生物学家罗杰·科恩伯格发现。中介体可与RNA聚合酶Ⅱ的C端结构域和转录因子结合,结合在基因的强化子和启动子之间,组成转录前起始复合体。RNA转录起始后中介体和转录因子不会马上自启动子脱离,而会维持在该处以继续结合新的RNA聚合酶Ⅱ,开启新一轮的转录。
5'侧翼区是一个靠近5'尾端的DNA区域。5'侧翼区承载启动子,也可能承载强化子,或是其他的蛋白质结合位点。这区域的DNA不会转译成RNA。不要与5′非转译区搞混,这区域既不会被转译成RNA,也不会被翻译成有功能的蛋白质。这些区域最主要的功能是调控蛋白质的转译。5'侧翼区在原核生物与真核生物中是不同的。
转录前起始复合体是真核生物与古菌细胞基因转录前由约100个蛋白质组成的复合体,真核生物转录MRNA的前起始复合体包括负责转录的RNA聚合酶Ⅱ、6种通用转录因子与其他辅助蛋白,组成过程中TFIID的TATA结合蛋白次单元首先在TFIIA的帮助下与DNA启动子的TATA盒结合,接着TFIIB也会与启动子上的BRE元件结合,D、A、B三者与启动子结合组成的复合体可再吸引TFIIF和RNA聚合酶Ⅱ前来,随后TFIIE、TFIIH再先后与复合体结合,后者结合DNA中的模板股,具解旋酶活性,可将启动子区域的DNA双股螺旋解开以形成转录泡,此外还具激酶活性,可将RNA聚合酶Ⅱ的C端结构域磷酸化以活化聚合酶开始转录。除了以上六种通用转录因子外,转录前起始复合体还包括中介体、染色质重塑酶、其他共同活化物等调控蛋白,其中中介子与转录前起始复合体结合后,可与距离较远的调控序列强化子结合以促进转录进行。古菌的转录前起始复合体与真核生物的类似,但较为简化,仅需TATA结合蛋白、TFIIB与RNA聚合酶,且转录因子与DNA结合的方向和真核生物的可能为相反。
调控序列是生物体内可以促进或抑制基因表达的核酸片段。调控序列可以是DNA中一段包含启动子、强化子、沉默子,以及一些调节蛋白附着位点的核酸片段。这些序列调控了基因的表达,进而影响蛋白质的蛋白质生物合成。除此之外,MRNA也有调控序列,可与RNA结合蛋白或其他RNA结合。
强化子RNA是真核生物基因组中强化子序列转录产生的非编码RNA,长50核碱基至4000nt之间,此类RNA于2010年由RNA测序与ChIP-seq等大规模测序技术测得。强化子为基因组中与RNA聚合酶Ⅱ、中介体和转录因子结合以启动基因转录的重要序列,其转录生成的强化子RNA大多留在细胞核中,此类RNA大多不稳定,易被细胞核中的外切体降解,但可能可调控其他基因的转录。并非所有强化子皆可转录,有研究显示仅有少数强化子可转录产生出eRNA,可能为较为活跃的强化子。有些强化子RNA具复杂的次级结构,并带有M6A等碱基修饰。
转录前起始复合体是真核生物与古菌细胞基因转录前由约100个蛋白质组成的复合体,真核生物转录MRNA的前起始复合体包括负责转录的RNA聚合酶Ⅱ、6种通用转录因子与其他辅助蛋白,组成过程中TFIID的TATA结合蛋白次单元首先在TFIIA的帮助下与DNA启动子的TATA盒结合,接着TFIIB也会与启动子上的BRE元件结合,D、A、B三者与启动子结合组成的复合体可再吸引TFIIF和RNA聚合酶Ⅱ前来,随后TFIIE、TFIIH再先后与复合体结合,后者结合DNA中的模板股,具解旋酶活性,可将启动子区域的DNA双股螺旋解开以形成转录泡,此外还具激酶活性,可将RNA聚合酶Ⅱ的C端结构域磷酸化以活化聚合酶开始转录。除了以上六种通用转录因子外,转录前起始复合体还包括中介体、染色质重塑酶、其他共同活化物等调控蛋白,其中中介子与转录前起始复合体结合后,可与距离较远的调控序列强化子结合以促进转录进行。古菌的转录前起始复合体与真核生物的类似,但较为简化,仅需TATA结合蛋白、TFIIB与RNA聚合酶,且转录因子与DNA结合的方向和真核生物的可能为相反。
转录前起始复合体是真核生物与古菌细胞基因转录前由约100个蛋白质组成的复合体,真核生物转录MRNA的前起始复合体包括负责转录的RNA聚合酶Ⅱ、6种通用转录因子与其他辅助蛋白,组成过程中TFIID的TATA结合蛋白次单元首先在TFIIA的帮助下与DNA启动子的TATA盒结合,接着TFIIB也会与启动子上的BRE元件结合,D、A、B三者与启动子结合组成的复合体可再吸引TFIIF和RNA聚合酶Ⅱ前来,随后TFIIE、TFIIH再先后与复合体结合,后者结合DNA中的模板股,具解旋酶活性,可将启动子区域的DNA双股螺旋解开以形成转录泡,此外还具激酶活性,可将RNA聚合酶Ⅱ的C端结构域磷酸化以活化聚合酶开始转录。除了以上六种通用转录因子外,转录前起始复合体还包括中介体、染色质重塑酶、其他共同活化物等调控蛋白,其中中介子与转录前起始复合体结合后,可与距离较远的调控序列强化子结合以促进转录进行。古菌的转录前起始复合体与真核生物的类似,但较为简化,仅需TATA结合蛋白、TFIIB与RNA聚合酶,且转录因子与DNA结合的方向和真核生物的可能为相反。
转录前起始复合体是真核生物与古菌细胞基因转录前由约100个蛋白质组成的复合体,真核生物转录MRNA的前起始复合体包括负责转录的RNA聚合酶Ⅱ、6种通用转录因子与其他辅助蛋白,组成过程中TFIID的TATA结合蛋白次单元首先在TFIIA的帮助下与DNA启动子的TATA盒结合,接着TFIIB也会与启动子上的BRE元件结合,D、A、B三者与启动子结合组成的复合体可再吸引TFIIF和RNA聚合酶Ⅱ前来,随后TFIIE、TFIIH再先后与复合体结合,后者结合DNA中的模板股,具解旋酶活性,可将启动子区域的DNA双股螺旋解开以形成转录泡,此外还具激酶活性,可将RNA聚合酶Ⅱ的C端结构域磷酸化以活化聚合酶开始转录。除了以上六种通用转录因子外,转录前起始复合体还包括中介体、染色质重塑酶、其他共同活化物等调控蛋白,其中中介子与转录前起始复合体结合后,可与距离较远的调控序列强化子结合以促进转录进行。古菌的转录前起始复合体与真核生物的类似,但较为简化,仅需TATA结合蛋白、TFIIB与RNA聚合酶,且转录因子与DNA结合的方向和真核生物的可能为相反。